📰 研究进展

酶工程优化常受制于崎岖的适应度景观和高昂的实验成本。本研究提出TeleProt——一种融合进化数据与实验数据的机器学习框架，用于设计多样化的蛋白文库，并成功提升了可降解慢性伤口生物膜的核酸酶催化活性。...

固态发酵（SSF）能够增强燕麦的生物活性潜力，但混合微生物体系中挥发性化合物形成的时间动态特征仍鲜有表征。本研究以少孢根霉单菌培养及少孢根霉与植物乳杆菌共培养体系对燕麦进行120小时固态发酵，鉴定出跨...

咖啡酸（CA）是一种具有广泛应用价值的酚类化合物，但微生物合成面临异源酶活性低和产物毒性两大瓶颈。本研究鉴定并工程化了来自伍氏醋酸杆菌的新型酚酸响应转录因子CarR，构建了对对香豆酸（p-CA）响应的...

乙酰辅酶A是众多高附加值产品的重要代谢前体，但恶臭假单胞菌（*Pseudomonas putida*）从糖类底物合成乙酰辅酶A的能力天然受限。本研究通过构建整合通量组学与代谢组学数据的动力学模型，结合...

蛋白质-配体结合亲和力是决定酶催化活性的关键因素，传统预测方法高度依赖高分辨率晶体结构，而部分蛋白晶体难以培养、耗时且昂贵。本研究构建了两个基于序列的神经网络深度学习模型——DeepPQK和DeepQ...

定向进化是蛋白质工程的核心手段，但耗时费力。机器学习辅助定向进化（MLDE）虽已被证明更高效，其适用条件却始终模糊。本研究系统评估了MLDE、主动学习及聚焦训练等策略在16个蛋白质适应度景观上的表现，...

圆红冬孢酵母（*Rhodotorula toruloides*）是极具潜力的工业产油酵母，但其同源重组（HR）效率极低，严重制约精准遗传改造。本研究系统评估了该酵母的DNA修复机制，通过过表达HR相关...

全球人口增长对农业增产提出严峻挑战，化学肥料和农药的过度使用带来环境代价。从摩洛哥干旱地区野生枣树（*Ziziphus lotus*）根系中分离内生细菌，筛选出具有多重促生特性的解淀粉芽孢杆菌ED24...

木聚糖酶是木质纤维素生物转化中的关键酶。本研究从伊朗26份环境样本中分离出18株细菌，筛选出两株高产木聚糖酶的菌株S3和S4，经分子鉴定为Bacillus spizizenii新变种。S3菌株在pH ...

木质纤维素是丰富的可再生碳源，但其天然抗降解屏障使整合生物加工（CBP）效率受限。本研究以嗜热毁丝霉（*Myceliophthora thermophila*）为底盘，通过转录组学锁定木质素降解为关键...

由茄科劳尔氏菌（*Ralstonia solanacearum*）引起的青枯病严重威胁全球番茄生产。本研究从甘肃油菜根际土壤中分离的短小芽孢杆菌（*Bacillus pumilus*）LP-823菌株...

紫花苜蓿蛋白含量高，却因可溶性碳水化合物不足、缓冲容量大而难以青贮。本研究系统对比了五种微生物接种剂、纤维素酶和双乙酸钠对苜蓿青贮发酵质量、菌群演替及代谢功能的影响。60天发酵后，KL接种剂和双乙酸钠...