底盘基因检索

底盘基因检索是面向代谢工程与合成生物学研究的底盘基因查询工具：在本地基因库中按底盘物种检索基因，支持基因名、别名、EC 号与功能描述模糊搜索，秒级返回基因注释、代谢通路归属与必需基因标记。工具覆盖大肠杆菌、酿酒酵母、毕赤酵母、枯草芽孢杆菌、谷氨酸棒杆菌、解脂耶氏酵母、恶臭假单胞菌、黑曲霉、乳酸乳球菌、多形汉逊酵母、集胞藻 11 种常用底盘，数据源自 KEGG 全量基因库（62,231 个基因），可用于代谢工程底盘选择、基因编辑靶点设计与通路构建前的基因信息核查。

KEGG 全量数据：6.2 万基因覆盖 11 种底盘

工具内置的基因库按 KEGG 全量基因数据构建，每种底盘均收录数千个基因——大肠杆菌 4,639 个、酿酒酵母 6,449 个、毕赤酵母 5,040 个、黑曲霉 14,166 个等，并附 EC 号、KO 号、代谢通路归属等注释。检索在本地数据库完成，无需等待外部接口，适合逐基因核对、批量查询与通路设计前的信息准备。

必需基因标记：敲除决策的实验依据

代谢工程中敲除必需基因会导致菌株致死、实验方案不可行。工具为每个基因标注必需性（基于 DEG 必需基因数据库），在检索结果中直接显示"必需"标记——设计基因敲除或代谢流改造前，可先确认目标基因是否必需，从数据层面规避不可行的实验方案。

菌株基因型与检索结合

工具同时收录 20 个常用工程菌株的基因型信息（如 BL21(DE3)、GS115 等的基因型、特点与培养条件），检索结果可与菌株信息对照，帮助选择与目标代谢改造匹配的底盘，并衔接站内代谢通路设计、表达模块设计器与质粒图谱绘制流程，形成从底盘选择、基因核查到通路构建的完整设计链路。