从「我的模块库」选择多个表达模块,设定顺序与方向,自动规划 Golden Gate 接缝组装 / 酵母体内同源重组路线,输出可执行克隆方案
多基因组装面向合成生物学与代谢工程研究:从「我的模块库」选择 2-8 个已设计的表达模块,设定通路中的组装顺序与正/反向,即可自动规划组装路线并输出可直接送去克隆实验的完整方案。支持体外 Golden Gate 接缝组装(2-4 个模块默认路线)与酿酒酵母体内同源重组(5 个及以上模块),适用于多基因共表达载体、代谢通路构建、多亚基复合物共表达等场景。
体外组装采用 YTK 标准接缝系统:自动为每个接缝分配 4bp 粘性末端,并对 BsaI/BsmBI/BbsI 违禁位点做 CDS 同义突变驯化(非编码区位点仅给人工建议),接缝兼容性给出效率等级标注。反应处方按模块摩尔比精确计算,输出各片段用量、酶量、连接酶浓度与热循环程序,可直接照方执行。
5 个及以上模块或用户显式选择时,走酿酒酵母体内同源重组路线:为每个转录单元生成 connector 同源臂与 TU 片段,推荐线性化载体并给出共转化方案。跨接缝自动生成验证引物与菌落 PCR 方案,阳性克隆概率与筛选策略一并给出。
组装输出最终环形通路质粒(真实载体骨架 + 用户选择的宿主筛选标记 + 串联 TU 表达盒)的 GenBank/FASTA,以及克隆步骤、跨接缝验证引物、菌落 PCR 方案与可打印的实验记录单。单模块设计保持纯表达模块输出(不注入宿主筛选标记/质粒骨架),骨架与宿主筛选标记仅在组装步骤选择并只出现在最终质粒中。组装方案附科研诚信声明——建议对组装产物做全序列测序验证与表达检测,确保计算机辅助设计经得起实验复现。多基因组装与站内「表达模块设计器」的单模块设计衔接使用:先在模块库中保存设计好的表达模块,再进入组装流程。
保存为可复用模块,之后可在「我的模块库」中一键载入继续编辑,本操作不消耗点数
上传自设计表达模块进「我的模块库」:A 结构化(选启动子/终止子 + 自设计 CDS 原样组装,不做密码子优化)或 B 纯序列(完整 TU 序列直接入库,无结构注释)。手动模块不消耗点数、无 AI 设计,可参与「多基因组装」全流程。
上传自定义元件进「个人元件库」:启动子 / RBS / CDS / 终止子 / 标签 / 信号肽 / 骨架。骨架上传后出现在「多基因组装 → 最终载体骨架」的「我的骨架」分组。上传不消耗点数,入库后为「待验证」状态,需人工复核后方可用于正式实验。