ORF 扫描与翻译
六框扫描 · NCBI 标准遗传密码表 · 完全免费
扫描正负链全部 6 个读框,识别开放阅读框(ORF)并按标准遗传密码表翻译为蛋白质序列,支持自定义起始密码子与最小长度。本地计算,无需登录。
⚡ 输入 DNA 序列
自动过滤数字、空格与换行;支持蛋白质翻译预览
使用教程
ORF 扫描与六框翻译使用说明
第一步:输入 DNA 序列。将双链 DNA 序列粘贴到输入框(自动过滤数字、空格与换行)。工具默认以 ATG 作为起始密码子,也可自定义其它起始密码子(如 GTG、TTG)。
第二步:设置参数。最小 ORF 长度默认为 20 个氨基酸(60 bp),可调低以发现短 ORF;开启「允许不完整 ORF」后,位于序列末端、无终止密码子的开放阅读框也会被报告,适合扫描质粒/病毒序列的末端片段。
第三步:点击「扫描 ORF」。工具对正链与负链(反向互补)各 3 个读框共 6 个读框扫描,按标准遗传密码表翻译,按长度从大到小列出每个 ORF 的起始位点、终止位点、长度与翻译的蛋白质序列,完整 ORF 会标出终止密码子。
结果解读:最长 ORF 通常对应真实编码基因;负链 ORF 的坐标按原始序列 1-based 位置标注。工具同时提供六框全翻译预览(序列 ≤ 2 万 bp 时),带 * 表示终止密码子,便于逐框核查。
ORF 扫描:从核酸序列到蛋白质编码区的第一步
开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)是 DNA 序列中从起始密码子(通常为 ATG)到终止密码子之间、可连续翻译为蛋白质的区段。ORF 扫描是基因注释、质粒构建与蛋白表达设计中最常用的分析步骤:一个基因的实际编码区必然对应一个无提前终止的较长 ORF,因此通过六框扫描即可快速定位候选编码基因。本工具支持正负链共 6 个读框的真实扫描,直接读取起始密码子并向后延伸,不做概率猜测,结果可逐框核对。
六框翻译原理:为什么需要看全部 6 个读框
双链 DNA 的每条链各有 3 个不同的读框,加起来共 6 个读框。实际基因可能位于任意一条链的任意读框中——细菌基因组约一半基因位于负链。工具将序列与其反向互补序列分别从 3 个移位起点扫描,把所有候选 ORF 按长度从大到小列出。真实基因通常是最长的 ORF(或显著长于背景 ORF),这一规律在序列较短(如质粒、合成片段)时尤为可靠,适合在实验前快速判断插入片段是否含完整编码框。
参数与结果解读:起始密码子、最小长度与完整 ORF
工具默认以 ATG 为起始密码子、最小 ORF 长度为 20 个氨基酸(60 bp),均可自定义。开启「允许不完整 ORF」后,序列末端无终止密码子的截断 ORF 也会报告,这对扫描质粒、病毒或合成片段末端尤为重要。结果中每个 ORF 均标注读框(+1/+2/+3 或 -1/-2/-3)、原始序列 1-based 起止坐标、长度(nt 与 aa)、是否含终止密码子(完整 ORF)以及翻译的蛋白质序列;六框全翻译预览中 * 表示终止密码子。
免费在线使用:本地计算保障序列安全
本工具全程本地计算,DNA 序列不会上传任何第三方服务器,适用于未发表课题的保密序列分析。无需注册登录、不消耗任何额度,单次最多支持 10 万 bp 序列。扫描结果支持复制,可直接用于后续引物设计、蛋白表达载体构建或提交 NCBI 注释。若需同时分析多条序列或批量注释基因,可配合本平台批量序列处理工具使用。