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🧬 转录因子-靶基因互作预测
输入TF名单与候选靶基因,扫描启动子结合位点 + 共表达 + 文献证据,输出酵母单杂(Y1H)验证候选对
① 转录因子名单
*
基因名列表,一行一个(如 AtWRKY33、OsNAC6、SlERF1)。支持家族:MYB/WRKY/NAC/bZIP/bHLH/ERF/MADS/TCP/GATA/Dof/HSF/ARF/B3/GRAS/SBP/HD-ZIP
📁 选择文件 (.txt)
🧪 填入测试数据
② 候选靶基因(DEG)列表
*
差异表达基因列表,一行一个(可与启动子FASTA的序列名对应)
📁 选择文件 (.txt)
🧪 填入测试数据
③ 启动子序列 FASTA
(选填,强烈建议)
候选靶基因启动子序列(-1500~+100 区域,>基因名 后接序列)。不填时仅凭表达矩阵共表达推断
📁 选择文件 (.fasta/.fa)
🧪 填入测试数据
④ 表达矩阵 CSV
(选填)
基因×样本表达矩阵(CSV/TSV,首列基因名)。系统自动识别行列方向与分隔符,用于共表达打分
📁 选择文件 (.csv/.tsv)
🧪 填入测试数据
⑤ 分析选项
扫描阈值
自动(按位点长度自适应,推荐)
严格 0.85
标准 0.80
宽松 0.75
检索已报道互作文献(增强排序,最多前8个TF)
🔬 开始分析
提交中...
🧬 候选互作对(按综合得分排序)
? TF家族富集
🧬 启动子结合位点图
📊 分析概况
⬇ 下载候选对CSV
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