来源:蛋白热稳定性差差示扫描荧光优化(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space
做DSF测Tm,曲线像面条?Tm比活性 assay 低10°C?别急着换蛋白。大概率是缓冲液、染料、浓度或升温速率在捣乱。本文从低级错误、样品条件、仪器参数到数据拟合,按实验流程拆开讲。你照着跑一遍,多数“热稳定性差”都能定位。
第一步:快速排查低级错误
1. 缓冲液里DMSO超过1%?SYPRO Orange母液是DMSO,蛋白也怕DMSO。解决:终浓度压到1%以下,设DMSO对照。
2. 染料直接加1 µL 5000×?终浓度变250×,荧光饱和。解决:算好终浓度5×,先用缓冲液稀释10×。
3. 蛋白浓度低于0.05 mg/mL?信号淹没在背景里。解决:浓缩到0.1–0.5 mg/mL,BCA定浓度。
4. 孔里有气泡或没封膜?曲线跳、边缘孔先蒸发。解决:1000 rpm离心1 min,封PCR膜,边缘孔加200 µL水。

第二步:分维度系统排查
1. 缓冲液pH和离子强度
现象:Tm偏低,曲线毛刺,首点荧光高。
原理:pH改变表面电荷,低盐加重聚集。
解决:换20 mM HEPES pH 7.5,加150 mM NaCl。蛋白pI 6.0时,避开pH 5.5