蛋白结晶初筛条件沉淀剂优化

来源:蛋白结晶初筛条件沉淀剂优化(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space

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蛋白纯化到95%,初筛板却清一色透明。别急着骂蛋白。沉淀剂优化没做好,晶体可能只是没被逼出来。本文按“低级错误→流程分维度→进阶疑难”排查,覆盖PEG、盐、pH、温度、添加剂、接种等常见坑。你照着做,少走两周弯路。

第一步:快速排查低级错误

1. 蛋白浓度太低或太高。现象:液滴一直清亮,或一上样就大量无定形沉淀。解决:A280测浓度,初筛调到5-10 mg/mL;若瞬间沉淀,降到2-5 mg/mL再试。

2. 池液加错或母液稀释错。现象:整板长得一模一样,连盐晶都不出。解决:重新核对母液,PEG 3350母液用0.22 µm过滤,盐母液现配,pH计校准。

3. 液滴没封住。现象:液滴干一半,或体积忽大忽小。解决:坐滴板压紧胶带,悬滴用硅化盖玻片,池液加50-100 µL,油层用石蜡油:硅油1:1。

4. 温度波动。现象:边缘孔和中间孔结果不同。解决:4°C和20°C各做一套,培养箱别频繁开门。

教程配图2:蛋白结晶初筛条件沉淀剂优化 排查流程示意
▲ 教程配图2:蛋白结晶初筛条件沉淀剂优化 排查流程示意

第二步:分维度系统排查

1. 沉淀剂类型选错

现象:清亮液滴多,偶有油滴或胶状。原理:PEG靠体积排阻,盐靠盐析,MPD兼有。蛋白性质不同,响应差别大。解决:首轮筛PEG 3350 10-25%、PEG 2000 15-30%、硫酸铵1.0-2.5 M、MPD 20-40%。用坐滴法,1 µL蛋白+1 µL池液,池液80 µL。验证:48 h看液滴,7天复看。清亮则升沉淀剂浓度10%。

2. 沉淀剂浓度梯度太粗

现象:只在某一行出微晶,但无法长大。原理:过饱和度窗口窄。解决:围绕出晶孔做24孔梯度,PEG 3350从12%到22%,每2%一档;硫酸铵从1.2到2.0 M,每0.1 M一档。16°C平衡。验证:记录出晶

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