糖基化蛋白异质性分析

来源:糖基化蛋白异质性分析(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space

📎 相关工具:质粒载体构建校验

同一批样品,别人跑出来是单一条带,你的却糊成一团?糖谱图上该出现的峰没出现,不该有的小峰一大堆?糖基化异质性分析难就难在“异质”两个字——同一个蛋白上挂着几十种糖型,任何一步参数漂移都会让结果变形。这篇教程按样品制备、去糖酶切、糖链标记、分离检测、数据处理五段拆开讲,每一步给现象、给参数、给验证动作。照着走一遍,八成问题能自己定位。

第一步:快速排查低级错误,这四类占了大半

教程配图2:糖基化蛋白异质性分析 排查流程示意
▲ 教程配图2:糖基化蛋白异质性分析 排查流程示意
教程配图3:糖基化蛋白异质性分析 排查流程示意
▲ 教程配图3:糖基化蛋白异质性分析 排查流程示意

1. 还原剂不新鲜。 糖蛋白常含多个二硫键,DTT或β-巯基乙醇失效后样品聚集,条带整体拖尾。解决:DTT现配现用,终浓度100 mM,95°C加热10分钟。

2. 酶早就失活。 PNGase F反复冻融三五次,活性掉一半以上,去糖不彻底。解决:分装成10 μL小管,−80°C存,每管只取一次。

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