T4连接酶效率低摩尔比

来源:T4连接酶效率低摩尔比(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space

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连接做了一整天,转化板上一片白。心里凉半截。别急着换酶,大概率是摩尔比和体系细节出了问题。T4连接酶效率低,不是玄学。载体多少ng,插入片段多少ng,比例怎么算,buffer冻融几次,PEG加没加,温度时间对不对,每个环节都能让连接效率掉到谷底。本文按操作流程拆解,从低级错误到进阶疑难,给你能直接照做的排查路径和具体参数。照着走,今晚就能把板子长出来。

第一步:快速排查低级错误

教程配图2:T4连接酶效率低摩尔比 排查流程示意
▲ 教程配图2:T4连接酶效率低摩尔比 排查流程示意
教程配图3:T4连接酶效率低摩尔比 排查流程示意
▲ 教程配图3:T4连接酶效率低摩尔比 排查流程示意

1. 浓度测错。NanoDrop测DNA浓度受RNA和盐干扰,摩尔比直接算歪。解决:用Qubit荧光定量,A260/A280控制在1.8-2.0。

2. 把质量比当摩尔比。载体100 ng,插入也加100 ng,以为1:1,实际插入分子数多出好几倍。解决:用公式算,插入ng = 载体ng × (插入bp/载体bp) × 目标摩尔比。

3. 连接酶反复冻融。T4酶每次拿室温,活性掉一半。解决:分装10 µL/管,-20°C保存,用前冰上融化

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