细胞培养污染检测支原体PCR

来源:细胞培养污染检测支原体PCR(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space

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细胞养着养着就变慢、飘、黑点?支原体污染最会装。PCR跑完没带、弱带、假阳性,一天白干。本文覆盖取样、提取、PCR体系、程序、对照、进阶疑难,给你能直接照做的排查路径。别猜,按顺序来。

第一步:快速排查低级错误

1. 取错样本。支原体主要在上清,你只刮细胞沉淀?直接取传代后48-72 h的1 mL上清,12000 g离心5 min,取上清。解决:弃沉淀,留上清。

2. 漏加模板。PCR体系配完忘了加DNA?设置加样顺序,先加水、缓冲液、引物、酶,最后加模板。解决:每管换枪头,加完标记。

3. 阳性对照失效。阳性对照没带,整批结果不可信。阳性对照用已知污染细胞上清提取的DNA,或10^4 CFU/mL支原体DNA。解决:阳性对照和样本一起提取,不要直接加质粒。

4. 阴性对照污染。水对照出带,试剂或气溶胶污染。解决:试剂分装成小份,每次新开,UV台操作,开盖前瞬时离心。

教程配图2:细胞培养污染检测支原体PCR 排查流程示意
▲ 教程配图2:细胞培养污染检测支原体PCR 排查流程示意

第二步:分维度系统排查

按流程走,别跳步。

1. 样本采集与处理

现象:阳性对照有条带,样本无带。原理:支原体滴度随培养时间变化,刚换液后上清中支原体少。解决:取传代后48-72 h上清,1 mL,12000 g离心5 min去除细胞碎片,取200 μL用于提取。若细胞密度低,延长到96 h。验证:用已知污染上清做10倍梯度稀释,测检测限。短句:别取刚换液的。

2. DNA提取

现象:所有管都无带,包括阳性对照。原理:支原体DNA量少,酚氯仿残留乙醇、盐会抑制Taq酶。解决:用柱式提取试剂盒,加1 μg carrier RNA,洗脱30 μL,55°C孵育2 h或过夜。直接煮沸法:上

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