来源:毛细管等电聚焦聚焦差两性电解质(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space
跑cIEF,最怕的不是没峰,是峰像被擀面杖压过:宽、矮、拖尾,pI标记也聚不拢。你换柱子、加电压、调pH,折腾一下午,结果还是糊。问题大概率不在仪器,而在两性电解质、样品基质和聚焦条件这三块。下面按“低级错误→系统排查→进阶疑难”三步走,把毛细管等电聚焦聚焦差的常见坑一次拆完。
第一步:快速排查低级错误
1. 两性电解质加错量或漏加。现象是pI标记都聚不锐,峰宽得离谱。直接看配方,常用2%–4% (v/v),别只加0.1%。
2. 样品盐浓度太高。现象是电流飙、峰位漂。用10 kDa超滤管换液3次,或透析2 h,让盐低于20–50 mM。
3. 毛细管没清洗或涂层老化。现象是迁移时间逐针变短、拖尾。每天先用0.1 M HCl冲5 min,水2 min,0.1 M NaOH冲5 min,水2 min。
4. 电压程序设错。现象是样品没聚焦就 mobilization。预聚焦15 kV 3 min,聚焦20–25 kV 15–30 min,别一上来就25 kV。

第二步:分维度系统排查
1. 样品前处理模块
原因1:盐和缓冲液组分干扰。
现象:聚焦时电流高、峰位漂,pI标记也偏。
原理:盐离子迁移率高,抢电流,破坏pH梯度;高盐还产热,让梯度塌。
解决:用0.5–2 mL超滤管换液3次,最终盐<20 mM;蛋白浓度0.1–1 mg/mL。含尿素样品用4–8 M尿素,DTT 10–50 mM,别加SDS。
验证:测电导,电导<1 mS/cm再进样;先只跑pI marker看聚焦。
原因2:蛋白在pI附近沉淀。
现象:峰突然消失,或出现尖刺,毛细管堵。
原理:蛋白在等电点溶解度最低,高浓度直接析出。
解决:稀释到0.1–0.5 mg/mL,加0.1%–0.5% methylcellulose或0.05% Tween-20,4°C操作。
验证:离心14000×g 10 min,看有无沉淀;换低浓度重跑。
2. 两性电解质与载体模块
原因1:两性电解质浓度或pH范围不对。