来源:Impedimetric detection of Escherichia coli with bacteriophage immobilized polyaniline-chitosan modified thread based biosensor for healthcare and water quality monitoring(Biosensors and Bioelectronics: X)| 编译:DNA Lab Space | 原文许可:elsevier-subscription
导读
大肠杆菌是生物研究、抗生素耐药性研究和环境监测中的模式微生物,其致病菌株引发的食源性和水源性感染对公共卫生构成重大威胁。本研究开发了一种一次性纤维素线基阻抗传感器,以T4噬菌体作为生物识别元件,通过聚苯胺-壳聚糖功能化修饰棉线基底,实现了对大肠杆菌B40的特异性检测。传感器在PBS和饮用水中的检测限为10³ CFU/mL,在模拟脑脊液样本中为10⁴ CFU/mL,并验证了对非宿主菌株和干扰物的特异性。
研究背景
大肠杆菌感染的临床治疗正变得日益困难,抗生素耐药性的流行使这一问题更加严峻。据《柳叶刀》报道,2019年耐药性大肠杆菌菌株导致了超过80万例死亡,而全球因抗微生物耐药性(AMR)导致的死亡总数估计达500万。这一日益加重的疾病负担迫切需要开发低成本、快速、可靠的细菌早期检测工具,尤其是在实验室基础设施有限的中低收入国家。
传统培养方法需要24-48小时才能出结果,且往往无法检测活的但不可培养状态(VBNC)的细菌。分子方法虽然灵敏度高,但成本高昂、耗时长,需要专业技术人员和精密仪器,在基层卫生中心的可及性受限。生物传感器是快速实时检测细菌病原体的分析工具。在各类传感器中,一次性阻抗传感器为即时病原体检测提供了便携、经济的替代方案。纤维素基纸和线传感器具有独特的优势,如生物相容性、可生物降解性等。
研究方法
2.1 试剂
中分子量壳聚糖(CS,50,000–190,000 Da)购自Merck,苯胺(分子质量93.13 g/mol)购自Himedia,过硫酸铵(APS)、氯仿、硫酸(H₂SO₄)和盐酸(37%)购自SRL Pvt Ltd。Ag/AgCl浆料购自Sigma Aldrich。LB肉汤、LB琼脂和琼脂粉购自Himedia。用于交叉敏感性研究的D-(+)-葡萄糖-右旋糖、白蛋白和免疫球蛋白(IgG)购自Sigma-Aldrich。所有培养基均在无菌蒸馏水中配制,使用前经高压灭菌。磷酸盐缓冲液(PBS)和SM缓冲液按标准方案配制。所有培养基和缓冲液使用前均经高压灭菌并储存在冰箱中。
【数据】壳聚糖分子量:50,000–190,000 Da;苯胺分子质量:93.13 g/mol;盐酸浓度:37%;储存温度:−20°C(甘油菌种)、4°C(噬菌体)
2.2 噬菌体计数和细菌培养制备
细菌样品大肠杆菌B40(ATCC11303)和大肠杆菌DH5 Alpha(ATCC 53868)以甘油菌种形式保存在−20°C冰箱中,在生长培养基中重悬后用于本实验。噬菌体T4(11303-B4)使用其宿主大肠杆菌B40进行扩增,纯化后储存在4°C。T4噬菌体的计数采用标准噬菌斑试验进行,以PFU/mL表示。从实验室附近水净化系统收集的饮用水经高压灭菌、注射器过滤和平板涂布,以确保在不同浓度大肠杆菌重悬前无固有细菌存在。模拟脑脊液(CSF)按照Sadani等人(2020)描述的方案制备。
【数据】菌株:大肠杆菌B40(ATCC11303)、大肠杆菌DH5 Alpha(ATCC 53868);噬菌体:T4(11303-B4);储存温度:−20°C(细菌)、4°C(噬菌体);计数单位:PFU/mL
2.3 传感器基底的制备
将纤维素棉线切割成1 cm的片段。将这些片段在去离子水中煮沸并干燥以去除松散沉淀物。风干后,将线在APS(强氧化剂)存在下进行苯胺(0.1 M)的氧化聚合反应,得到PAni涂覆的线。这些线进一步风干,随后通过浸涂法涂覆0.1% CS溶液。共进行12次浸涂循环以确保所有基底上薄膜厚度均匀。干燥后,将制备在0.1 M KCl中的Ag/AgCl导电墨水施加到电极一端,用作伪参比电极并提供修饰线与连接夹之间的电接触。干燥后,将PAni-CS涂覆的线与T4噬菌体(10⁹ PFU/mL)孵育。使用扫描电子显微镜(SEM)(JEOL JSM-7600)表征传感器表面并观察孵育后的细菌相互作用。

【数据】线长度:1 cm;苯胺浓度:0.1 M;CS浓度:0.1%;浸涂循环:12次;Ag/AgCl墨水溶剂:0.1 M KCl;噬菌体浓度:10⁹ PFU/mL;仪器:JEOL JSM-7600 SEM
2.4 大肠杆菌B40的阻抗检测
将功能化线通过环形导线连接到恒电位仪,如图1a所示。所有电化学测量均使用FRA32M频率响应分析模块,与Autolab PGSTAT(Metrohm)联用。首先,将线在SM缓冲液中进行T4噬菌体(10⁹ PFU/mL)的固定化,持续1小时。施加+0.5 V的正电位(vs. Ag/AgCl伪参比电极)以促进噬菌体的定向固定化。施加的电位使电极表面带正电,在表面附近产生电场,吸引带负电的噬菌体。这使噬菌体以其带负电的头部朝向电极方向排列。使用高噬菌体浓度(10⁹ PFU/mL)以确保更大的MOI和与细菌裂解对应的可测量信号响应。然后用SM缓冲液冲洗线以去除任何未结合的噬菌体,并在真空下干燥。由于pH和离子强度的变化会影响测量,实验在标准化PBS(pH 7.2,10 mM PBS)中进行,这为噬菌体活性和阻抗测量提供了稳定的环境。在PBS中稳定45分钟后,将噬菌体功能化的线与不同浓度的大肠杆菌悬浮液(10²、10³、10⁴、10⁵和10⁶ CFU/mL,制备于PBS中)孵育,随后进行阻抗测量。使用EIS评估大肠杆菌B40与T4固定化线之间的相互作用,以PBS作为对照。阻抗数据以15分钟为间隔收集,频率范围为10 kHz至5 Hz。噬菌体取向和细菌固定化的示意图见图1b。对于实际样品测试,所有测试基质均含有实验室配制的标准缓冲参考溶液。该标准溶液包含样品基质中可能存在的所有典型成分。一旦达到稳定,将传感器与目标分析物孵育,分析物与实验室参考溶液以1:1比例缓冲,记录所得的阻抗变化。这有助于减轻基质效应。展示配制的缓冲模拟基质的表格见SI-2。

【数据】噬菌体浓度:10⁹ PFU/mL;施加电位:+0.5 V;固定化时间:1 h;PBS浓度:10 mM,pH 7.2;稳定时间:45 min;大肠杆菌浓度:10²、10³、10⁴、10⁵、10⁶ CFU/mL;阻抗采集间隔:15 min;频率范围:10 kHz至5 Hz;分析物与参考溶液比例:1:1
研究结果
3.1 线基底的表征
使用Bruker Alpha II光谱仪在衰减全反射(ATR)模式下对PAni-CS功能化线进行傅里叶变换红外光谱(FTIR)分析(图1c)。PAni-CS涂覆线的FTIR光谱显示在3254 cm⁻¹处有一个宽峰,对应于PAni和CS的N–H伸缩振动。2854 cm⁻¹处的峰归因于对称C–H伸缩振动。1579 cm⁻¹处的峰可归因于醌型的伸缩振动。1499 cm⁻¹处观察到的峰归因于苯环的伸缩振动。1418 cm⁻¹处的峰可归属于CS吡喃环中CH₂的伸缩振动。1310 cm⁻¹处的峰对应于仲芳香胺的C–N伸缩。1155 cm⁻¹处的峰可归因于CS的C–O–C桥的不对称伸缩。1107 cm⁻¹和806 cm⁻¹处的峰分别可归属于苯环的C–N伸缩模式和芳香C-H面外弯曲振动。使用聚焦离子束扫描电子显微镜(FIB-SEM)检查PAni-CS修饰线的表面形貌。表面呈现粗糙多孔。CS形成多孔纤维网络,而PAni以颗粒形式分布在CS网络表面。形貌还表明PAni与CS之间存在界面接触。图1(d–i)显示了PAni-CS涂覆线的SEM横截面图像,揭示了高度纤维化和多孔的结构,为后续修饰提供了大的表面积。图1(d-ii)展示了修饰线的表面形貌。图1(d-iii)展示了PAni-CS复合层,其中PAni形成短纤维网络,而CS填充间隙空间。这增强了表面粗糙度并促进噬菌体固定化,从而促进大肠杆菌细胞的结合。图1(d-iv)显示了大肠杆菌的放大图像,其呈现为变形杆状,可能表明细菌裂解过程。PAni和PAni-CS的表面积也通过Brunauer Emmett Teller(BET)表征使用Smart Sorb 92/93表面积分析仪进行分析。结果见SI-3表3。PAni-CS复合材料表面积的减小是由于CS阻塞了PAni纳米纤维的孔隙。
【数据】FTIR峰位:3254、2854、1579、1499、1418、1310、1155、1107、806 cm⁻¹;仪器:Bruker Alpha II(ATR模式)、FIB-SEM、Smart Sorb 92/93 BET分析仪
3.2 电化学表征及PBS中大肠杆菌检测
EIS用于进一步表征传感器基底并监测其逐步修饰过程。图2显示了每个制备步骤(包括裸线、PAni-CS线、CS沉积的PAni线、随后的T4噬菌体固定化和大肠杆菌结合)的EIS测量所得Nyquist图。用于拟合EIS数据的等效电路显示在插图中,各修饰步骤的相应拟合参数总结在表1中。用导电聚合物PAni修饰裸线后,观察到电荷转移电阻(Rct)降低。随后浸涂CS导致Rct进一步降低,表明PAni和CS之间的协同效应改善了结构完整性和导电性。将噬菌体T4孵育到修饰线上后,Rct增加,表明有效的噬菌体结合。与细菌溶液孵育10分钟后观察到Rct进一步增加,证实了固定化噬菌体对细菌细胞的捕获。相应的拟合参数包括Rsol(Ω)、Rct(Ω)和Q1(Ω⁻¹·sⁿ)总结在表4(SI-3.A)中。此外,逐步修饰的有效双电层电容(Cdl)、比电容(Cs)和电活性表面积(ECSA)已计算,详情见SI-3-A。噬菌体(10⁹ PFU/mL)在PAni-CS杂化线上的固定化通过EIS确认(SI-3.B)。线在含T4噬菌体的500 μL SM缓冲液中孵育。线基底的长度优化为1 cm,基于T4噬菌体固定化所需的有效表面积,同时防止线折叠。长度优化的详细研究见SI-3.C。虽然仅50 μL就足以完全润湿1 cm长度的线,但更高体积确保孵育期间线完全浸没。基于样品浓度,预计约10⁷ PFU接触线表面。为验证噬菌体固定化,通过噬菌斑试验定量,定期测量从线解吸的噬菌体浓度。解吸噬菌体的浓度随时间降低,表明强结合的噬菌体保持固定在线上的。结果见SI-3.D。图3a显示了噬菌体在PAni-CS基底上结合动力学的Nyquist图。构建了电等效电路以拟合EIS数据,如图3a插图所示。Rct随时间的变化表明噬菌体在线的表面逐步固定化,约50分钟后开始稳定(图3b)。T4噬菌体带负电的衣壳与带正电的PAni-CS线发生静电相互作用,促进固定化。施加+0.5 V正电位促进了噬菌体的定点取向,促进有效的细菌结合。将噬菌体功能化的线在大肠杆菌(10³-10⁶ CFU/mL)悬浮液(PBS中)中孵育1小时后,大肠杆菌B40与T4噬菌体的初始结合增加了阻抗。随后由于细菌裂解,阻抗在大约30分钟内下降,如图3c所示。图3d描绘了Nyquist图。噬菌体功能化线在细菌悬浮液中的Rct(t = 30 min)低于仅PBS中的,可能是由于培养基中发生的细菌裂解。通过改变细菌浓度(10³-10⁶ CFU/mL)同时保持线上噬菌体浓度恒定,进行了浓度依赖性研究。构建了等效电路模型,并监测溶液电阻(Rsol)的变化。分析显示Rsol随细菌浓度增加而降低。当噬菌体与线上的细菌结合时,电极-电解质界面的溶液电阻发生变化,影响局部离子浓度和迁移率,从而增加系统的有效电导率。因此,更高的细菌浓度导致更低的溶液电阻,如图3e所示。在测定过程中研究了细菌计数、pH、吸光度变化和噬菌体效价等参数,以评估本体溶液中产生的物理化学变化(SI-3-E和F)。

【数据】噬菌体浓度:10⁹ PFU/mL;SM缓冲液体积:500 μL;线长度:1 cm;预计接触噬菌体量:约10⁷ PFU;噬菌体固定化稳定时间:约50 min;施加电位:+0.5 V;大肠杆菌浓度:10³-10⁶ CFU/mL;孵育时间:1 h;细菌裂解时间:约30 min
3.3 实际样品测试
为评估T4固定化线生物传感器在实际样品中的性能,将不同浓度的大肠杆菌B40(10³-10⁷ CFU/mL,经平板计数确认)重悬于饮用水和人工CSF样品中。在两种样品类型中,归一化溶液电阻随大肠杆菌浓度增加而降低,证明了该生物传感器对大肠杆菌B40选择性检测的有效性和可行性。观察到的选择性源于T4噬菌体的特异性结合和裂解活性,其不与非宿主细菌菌株相互作用。该传感器在饮用水中的检测限为10³ CFU/mL,在模拟CSF样品中为10⁴ CFU/mL,检测对数范围分别为10³-10⁶ CFU/mL和10⁴-10⁷ CFU/mL。


【数据】大肠杆菌浓度范围:10³-10⁷ CFU/mL;饮用水中检测限:10³ CFU/mL;模拟CSF中检测限:10⁴ CFU/mL;饮用水检测范围:10³-10⁶ CFU/mL;模拟CSF检测范围:10⁴-10⁷ CFU/mL
讨论与解读
本研究开发了一种一次性、经济高效的线基传感器,使用噬菌体T4作为生物识别元件,用于快速、特异性地检测大肠杆菌B40。该传感器设计简单、易于批量制造、具有生物相容性,适合即时/护理点应用。当代文献中大多数传感器需要使用抗体或适配体等生物识别元件,这些元件昂贵且需要严格的操作条件。然而,噬菌体在实验室环境中易于纯化和维持。纤维素线通过APS原位氧化聚合苯胺形成PAni进行修饰。APS通过氧化苯胺形成苯胺阳离子自由基启动聚合,这些自由基偶联形成聚合物链。纤维素纤维的羟基(-OH)与PAni的胺基(-NH)之间的强分子间氢键稳定了PAni-纤维素相互作用。PAni涂覆的线随后涂覆CS,通过氢键相互作用。PAni-CS修饰的线由于末端-NH₂基团的存在而具有整体净正电荷。这促进了T4噬菌体带负电头部的结合。当暴露于携带净负电荷的大肠杆菌B40时,T4噬菌体尾丝与细菌全细胞之间发生结合,随后细菌裂解和细菌裂解物在基底上积累。
编译者解读
该研究在合成生物学与生物传感的交叉领域提供了一个务实的方案:用噬菌体替代抗体作为识别元件,大幅降低了成本并简化了操作条件。线基基底的选择兼顾了柔性与可规模化生产,PAni-CS涂层通过静电作用实现噬菌体定向固定,思路清晰。然而,传感器在模拟CSF中检测限升至10⁴ CFU/mL,提示复杂基质对性能有实质影响;噬菌体在基底上的长期稳定性数据也尚不充分。未来若能将噬菌体工程化改造以拓展宿主谱,或整合微流控实现多靶标并行检测,将进一步提升其在临床和环境监测中的实用价值。
参考来源
期刊:Biosensors and Bioelectronics: X, 2026
DOI: 10.1016/j.biosx.2026.100778
DOI: 10.1016/j.biosx.2026.100778