噬菌体固定化聚苯胺-壳聚糖修饰线基生物传感器

来源:Impedimetric detection of Escherichia coli with bacteriophage immobilized polyaniline-chitosan modified thread based biosensor for healthcare and water quality monitoring(Biosensors and Bioelectronics: X)| 编译:DNA Lab Space | 原文许可:elsevier-subscription

📎 相关工具:蛋白可溶性优化分析

导读

大肠杆菌是生物研究、抗生素耐药性研究和环境监测中的模式微生物,其致病菌株引发的食源性和水源性感染对公共卫生构成重大威胁。本研究开发了一种一次性纤维素线基阻抗传感器,以T4噬菌体作为生物识别元件,通过聚苯胺-壳聚糖功能化修饰棉线基底,实现了对大肠杆菌B40的特异性检测。传感器在PBS和饮用水中的检测限为10³ CFU/mL,在模拟脑脊液样本中为10⁴ CFU/mL,并验证了对非宿主菌株和干扰物的特异性。

研究背景

大肠杆菌感染的临床治疗正变得日益困难,抗生素耐药性的流行使这一问题更加严峻。据《柳叶刀》报道,2019年耐药性大肠杆菌菌株导致了超过80万例死亡,而全球因抗微生物耐药性(AMR)导致的死亡总数估计达500万。这一日益加重的疾病负担迫切需要开发低成本、快速、可靠的细菌早期检测工具,尤其是在实验室基础设施有限的中低收入国家。

传统培养方法需要24-48小时才能出结果,且往往无法检测活的但不可培养状态(VBNC)的细菌。分子方法虽然灵敏度高,但成本高昂、耗时长,需要专业技术人员和精密仪器,在基层卫生中心的可及性受限。生物传感器是快速实时检测细菌病原体的分析工具。在各类传感器中,一次性阻抗传感器为即时病原体检测提供了便携、经济的替代方案。纤维素基纸和线传感器具有独特的优势,如生物相容性、可生物降解性等。

研究方法

2.1 试剂

中分子量壳聚糖(CS,50,000–190,000 Da)购自Merck,苯胺(分子质量93.13 g/mol)购自Himedia,过硫酸铵(APS)、氯仿、硫酸(H₂SO₄)和盐酸(37%)购自SRL Pvt Ltd。Ag/AgCl浆料购自Sigma Aldrich。LB肉汤、LB琼脂和琼脂粉购自Himedia。用于交叉敏感性研究的D-(+)-葡萄糖-右旋糖、白蛋白和免疫球蛋白(IgG)购自Sigma-Aldrich。所有培养基均在无菌蒸馏水中配制,使用前经高压灭菌。磷酸盐缓冲液(PBS)和SM缓冲液按标准方案配制。所有培养基和缓冲液使用前均经高压灭菌并储存在冰箱中。

【数据】壳聚糖分子量:50,000–190,000 Da;苯胺分子质量:93.13 g/mol;盐酸浓度:37%;储存温度:−20°C(甘油菌种)、4°C(噬菌体)

2.2 噬菌体计数和细菌培养制备

细菌样品大肠杆菌B40(ATCC11303)和大肠杆菌DH5 Alpha(ATCC 53868)以甘油菌种形式保存在−20°C冰箱中,在生长培养基中重悬后用于本实验。噬菌体T4(11303-B4)使用其宿主大肠杆菌B40进行扩增,纯化后储存在4°C。T4噬菌体的计数采用标准噬菌斑试验进行,以PFU/mL表示。从实验室附近水净化系统收集的饮用水经高压灭菌、注射器过滤和平板涂布,以确保在不同浓度大肠杆菌重悬前无固有细菌存在。模拟脑脊液(CSF)按照Sadani等人(2020)描述的方案制备。

【数据】菌株:大肠杆菌B40(ATCC11303)、大肠杆菌DH5 Alpha(ATCC 53868);噬菌体:T4(11303-B4);储存温度:−20°C(细菌)、4°C(噬菌体);计数单位:PFU/mL

2.3 传感器基底的制备

将纤维素棉线切割成1 cm的片段。将这些片段在去离子水中煮沸并干燥以去除松散沉淀物。风干后,将线在APS(强氧化剂)存在下进行苯胺(0.1 M)的氧化聚合反应,得到PAni涂覆的线。这些线进一步风干,随后通过浸涂法涂覆0.1% CS溶液。共进行12次浸涂循环以确保所有基底上薄膜厚度均匀。干燥后,将制备在0.1 M KCl中的Ag/AgCl导电墨水施加到电极一端,用作伪参比电极并提供修饰线与连接夹之间的电接触。干燥后,将PAni-CS涂覆的线与T4噬菌体(10⁹ PFU/mL)孵育。使用扫描电子显微镜(SEM)(JEOL JSM-7600)表征传感器表面并观察孵育后的细菌相互作用。

(a) photograph of experimental set-up (b) schematic representation of E. coli detection using T4 bacteriophage functionalized thread biosensor (c) FTIR of PAni-CS thread (d) SEM images of bacterial binding on bacteriophage functionalized PAni-CS coated thread (i-iii) SEM image of PAni/CS hybrid thre
▲ (a) photograph of experimental set-up (b) schematic representation of E. coli detection using T4 bacteriophage functionalized thread biosensor (c) FTIR of PAni-CS thread (d) SEM images of bacterial binding on bacteriophage functionalized PAni-CS coated thread (i-iii) SEM image of PAni/CS hybrid thre

【数据】线长度:1 cm;苯胺浓度:0.1 M;CS浓度:0.1%;浸涂循环:12次;Ag/AgCl墨水溶剂:0.1 M KCl;噬菌体浓度:10⁹ PFU/mL;仪器:JEOL JSM-7600 SEM

2.4 大肠杆菌B40的阻抗检测

将功能化线通过环形导线连接到恒电位仪,如图1a所示。所有电化学测量均使用FRA32M频率响应分析模块,与Autolab PGSTAT(Metrohm)联用。首先,将线在SM缓冲液中进行T4噬菌体(10⁹ PFU/mL)的固定化,持续1小时。施加+0.5 V的正电位(vs. Ag/AgCl伪参比电极)以促进噬菌体的定向固定化。施加的电位使电极表面带正电,在表面附近产生电场,吸引带负电的噬菌体。这使噬菌体以其带负电的头部朝向电极方向排列。使用高噬菌体浓度(10⁹ PFU/mL)以确保更大的MOI和与细菌裂解对应的可测量信号响应。然后用SM缓冲液冲洗线以去除任何未结合的噬菌体,并在真空下干燥。由于pH和离子强度的变化会影响测量,实验在标准化PBS(pH 7.2,10 mM PBS)中进行,这为噬菌体活性和阻抗测量提供了稳定的环境。在PBS中稳定45分钟后,将噬菌体功能化的线与不同浓度的大肠杆菌悬浮液(10²、10³、10⁴、10⁵和10⁶ CFU/mL,制备于PBS中)孵育,随后进行阻抗测量。使用EIS评估大肠杆菌B40与T4固定化线之间的相互作用,以PBS作为对照。阻抗数据以15分钟为间隔收集,频率范围为10 kHz至5 Hz。噬菌体取向和细菌固定化的示意图见图1b。对于实际样品测试,所有测试基质均含有实验室配制的标准缓冲参考溶液。该标准溶液包含样品基质中可能存在的所有典型成分。一旦达到稳定,将传感器与目标分析物孵育,分析物与实验室参考溶液以1:1比例缓冲,记录所得的阻抗变化。这有助于减轻基质效应。展示配制的缓冲模拟基质的表格见SI-2。

使用EIS进行基底表征。
▲ 使用EIS进行基底表征。

【数据】噬菌体浓度:10⁹ PFU/mL;施加电位:+0.5 V;固定化时间:1 h;PBS浓度:10 mM,pH 7.2;稳定时间:45 min;大肠杆菌浓度:10²、10³、10⁴、10⁵、10⁶ CFU/mL;阻抗采集间隔:15 min;频率范围:10 kHz至5 Hz;分析物与参考溶液比例:1:1

研究结果

3.1 线基底的表征

使用Bruker Alpha II光谱仪在衰减全反射(ATR)模式下对PAni-CS功能化线进行傅里叶变换红外光谱(FTIR)分析(图1c)。PAni-CS涂覆线的FTIR光谱显示在3254 cm⁻¹处有一个宽峰,对应于PAni和CS的N–H伸缩振动。2854 cm⁻¹处的峰归因于对称C–H伸缩振动。1579 cm⁻¹处的峰可归因于醌型的伸缩振动。1499 cm⁻¹处观察到的峰归因于苯环的伸缩振动。1418 cm⁻¹处的峰可归属于CS吡喃环中CH₂的伸缩振动。1310 cm⁻¹处的峰对应于仲芳香胺的C–N伸缩。1155 cm⁻¹处的峰可归因于CS的C–O–C桥的不对称伸缩。1107 cm⁻¹和806 cm⁻¹处的峰分别可归属于苯环的C–N伸缩模式和芳香C-H面外弯曲振动。使用聚焦离子束扫描电子显微镜(FIB-SEM)检查PAni-CS修饰线的表面形貌。表面呈现粗糙多孔。CS形成多孔纤维网络,而PAni以颗粒形式分布在CS网络表面。形貌还表明PAni与CS之间存在界面接触。图1(d–i)显示了PAni-CS涂覆线的SEM横截面图像,揭示了高度纤维化和多孔的结构,为后续修饰提供了大的表面积。图1(d-ii)展示了修饰线的表面形貌。图1(d-iii)展示了PAni-CS复合层,其中PAni形成短纤维网络,而CS填充间隙空间。这增强了表面粗糙度并促进噬菌体固定化,从而促进大肠杆菌细胞的结合。图1(d-iv)显示了大肠杆菌的放大图像,其呈现为变形杆状,可能表明细菌裂解过程。PAni和PAni-CS的表面积也通过Brunauer Emmett Teller(BET)表征使用Smart Sorb 92/93表面积分析仪进行分析。结果见SI-3表3。PAni-CS复合材料表面积的减小是由于CS阻塞了PAni纳米纤维的孔隙。

【数据】FTIR峰位:3254、2854、1579、1499、1418、1310、1155、1107、806 cm⁻¹;仪器:Bruker Alpha II(ATR模式)、FIB-SEM、Smart Sorb 92/93 BET分析仪

3.2 电化学表征及PBS中大肠杆菌检测

EIS用于进一步表征传感器基底并监测其逐步修饰过程。图2显示了每个制备步骤(包括裸线、PAni-CS线、CS沉积的PAni线、随后的T4噬菌体固定化和大肠杆菌结合)的EIS测量所得Nyquist图。用于拟合EIS数据的等效电路显示在插图中,各修饰步骤的相应拟合参数总结在表1中。用导电聚合物PAni修饰裸线后,观察到电荷转移电阻(Rct)降低。随后浸涂CS导致Rct进一步降低,表明PAni和CS之间的协同效应改善了结构完整性和导电性。将噬菌体T4孵育到修饰线上后,Rct增加,表明有效的噬菌体结合。与细菌溶液孵育10分钟后观察到Rct进一步增加,证实了固定化噬菌体对细菌细胞的捕获。相应的拟合参数包括Rsol(Ω)、Rct(Ω)和Q1(Ω⁻¹·sⁿ)总结在表4(SI-3.A)中。此外,逐步修饰的有效双电层电容(Cdl)、比电容(Cs)和电活性表面积(ECSA)已计算,详情见SI-3-A。噬菌体(10⁹ PFU/mL)在PAni-CS杂化线上的固定化通过EIS确认(SI-3.B)。线在含T4噬菌体的500 μL SM缓冲液中孵育。线基底的长度优化为1 cm,基于T4噬菌体固定化所需的有效表面积,同时防止线折叠。长度优化的详细研究见SI-3.C。虽然仅50 μL就足以完全润湿1 cm长度的线,但更高体积确保孵育期间线完全浸没。基于样品浓度,预计约10⁷ PFU接触线表面。为验证噬菌体固定化,通过噬菌斑试验定量,定期测量从线解吸的噬菌体浓度。解吸噬菌体的浓度随时间降低,表明强结合的噬菌体保持固定在线上的。结果见SI-3.D。图3a显示了噬菌体在PAni-CS基底上结合动力学的Nyquist图。构建了电等效电路以拟合EIS数据,如图3a插图所示。Rct随时间的变化表明噬菌体在线的表面逐步固定化,约50分钟后开始稳定(图3b)。T4噬菌体带负电的衣壳与带正电的PAni-CS线发生静电相互作用,促进固定化。施加+0.5 V正电位促进了噬菌体的定点取向,促进有效的细菌结合。将噬菌体功能化的线在大肠杆菌(10³-10⁶ CFU/mL)悬浮液(PBS中)中孵育1小时后,大肠杆菌B40与T4噬菌体的初始结合增加了阻抗。随后由于细菌裂解,阻抗在大约30分钟内下降,如图3c所示。图3d描绘了Nyquist图。噬菌体功能化线在细菌悬浮液中的Rct(t = 30 min)低于仅PBS中的,可能是由于培养基中发生的细菌裂解。通过改变细菌浓度(10³-10⁶ CFU/mL)同时保持线上噬菌体浓度恒定,进行了浓度依赖性研究。构建了等效电路模型,并监测溶液电阻(Rsol)的变化。分析显示Rsol随细菌浓度增加而降低。当噬菌体与线上的细菌结合时,电极-电解质界面的溶液电阻发生变化,影响局部离子浓度和迁移率,从而增加系统的有效电导率。因此,更高的细菌浓度导致更低的溶液电阻,如图3e所示。在测定过程中研究了细菌计数、pH、吸光度变化和噬菌体效价等参数,以评估本体溶液中产生的物理化学变化(SI-3-E和F)。

Electrochemical characterization and E. coli detection in PBS (a) Nyquist plot with equivalent circuit shown in the inset, indicating increase in Rct indicating phage binding on PAni-CS substrate (b) Time dependent increase in Rct during phage binding, attains saturation in 50 min (c) initial increa
▲ Electrochemical characterization and E. coli detection in PBS (a) Nyquist plot with equivalent circuit shown in the inset, indicating increase in Rct indicating phage binding on PAni-CS substrate (b) Time dependent increase in Rct during phage binding, attains saturation in 50 min (c) initial increa

【数据】噬菌体浓度:10⁹ PFU/mL;SM缓冲液体积:500 μL;线长度:1 cm;预计接触噬菌体量:约10⁷ PFU;噬菌体固定化稳定时间:约50 min;施加电位:+0.5 V;大肠杆菌浓度:10³-10⁶ CFU/mL;孵育时间:1 h;细菌裂解时间:约30 min

3.3 实际样品测试

为评估T4固定化线生物传感器在实际样品中的性能,将不同浓度的大肠杆菌B40(10³-10⁷ CFU/mL,经平板计数确认)重悬于饮用水和人工CSF样品中。在两种样品类型中,归一化溶液电阻随大肠杆菌浓度增加而降低,证明了该生物传感器对大肠杆菌B40选择性检测的有效性和可行性。观察到的选择性源于T4噬菌体的特异性结合和裂解活性,其不与非宿主细菌菌株相互作用。该传感器在饮用水中的检测限为10³ CFU/mL,在模拟CSF样品中为10⁴ CFU/mL,检测对数范围分别为10³-10⁶ CFU/mL和10⁴-10⁷ CFU/mL。

Real sample testing (a) Detection of E. coli B40 in drinking water samples (b) Detection of E. coli B40 in simulated CSF samples. The sensor showed a LoD of 103 CFU/mL and104 CFU/mL for drinking water and simulated CSF samples respectively. Each point in the calibration represents n = 3.
▲ Real sample testing (a) Detection of E. coli B40 in drinking water samples (b) Detection of E. coli B40 in simulated CSF samples. The sensor showed a LoD of 103 CFU/mL and104 CFU/mL for drinking water and simulated CSF samples respectively. Each point in the calibration represents n = 3.
(a) Standard plaque assay using T4 phage with non-host bacteria E. coli DH5 Alpha and host bacteria E. coli B40. No plaque formation was observed with E. coli DH5 Alpha (b) Decrease in solution resistance exhibited by E. coli B40 with increasing bacterial concentration, versus no response shown by t
▲ (a) Standard plaque assay using T4 phage with non-host bacteria E. coli DH5 Alpha and host bacteria E. coli B40. No plaque formation was observed with E. coli DH5 Alpha (b) Decrease in solution resistance exhibited by E. coli B40 with increasing bacterial concentration, versus no response shown by t

【数据】大肠杆菌浓度范围:10³-10⁷ CFU/mL;饮用水中检测限:10³ CFU/mL;模拟CSF中检测限:10⁴ CFU/mL;饮用水检测范围:10³-10⁶ CFU/mL;模拟CSF检测范围:10⁴-10⁷ CFU/mL

讨论与解读

本研究开发了一种一次性、经济高效的线基传感器,使用噬菌体T4作为生物识别元件,用于快速、特异性地检测大肠杆菌B40。该传感器设计简单、易于批量制造、具有生物相容性,适合即时/护理点应用。当代文献中大多数传感器需要使用抗体或适配体等生物识别元件,这些元件昂贵且需要严格的操作条件。然而,噬菌体在实验室环境中易于纯化和维持。纤维素线通过APS原位氧化聚合苯胺形成PAni进行修饰。APS通过氧化苯胺形成苯胺阳离子自由基启动聚合,这些自由基偶联形成聚合物链。纤维素纤维的羟基(-OH)与PAni的胺基(-NH)之间的强分子间氢键稳定了PAni-纤维素相互作用。PAni涂覆的线随后涂覆CS,通过氢键相互作用。PAni-CS修饰的线由于末端-NH₂基团的存在而具有整体净正电荷。这促进了T4噬菌体带负电头部的结合。当暴露于携带净负电荷的大肠杆菌B40时,T4噬菌体尾丝与细菌全细胞之间发生结合,随后细菌裂解和细菌裂解物在基底上积累。

编译者解读

该研究在合成生物学与生物传感的交叉领域提供了一个务实的方案:用噬菌体替代抗体作为识别元件,大幅降低了成本并简化了操作条件。线基基底的选择兼顾了柔性与可规模化生产,PAni-CS涂层通过静电作用实现噬菌体定向固定,思路清晰。然而,传感器在模拟CSF中检测限升至10⁴ CFU/mL,提示复杂基质对性能有实质影响;噬菌体在基底上的长期稳定性数据也尚不充分。未来若能将噬菌体工程化改造以拓展宿主谱,或整合微流控实现多靶标并行检测,将进一步提升其在临床和环境监测中的实用价值。

参考来源

期刊:Biosensors and Bioelectronics: X, 2026

DOI: 10.1016/j.biosx.2026.100778

DOI: 10.1016/j.biosx.2026.100778

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