qPCR扩增曲线异常引物二聚体

来源:qPCR扩增曲线异常引物二聚体(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space

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qPCR跑完,扩增曲线拖尾、NTC起峰、熔解曲线多出一个小峰——大概率是引物二聚体在捣乱。别急着换试剂。先看NTC,再看引物浓度和退火温度。本文按“快速排低级错→分模块查体系/引物/程序/数据→进阶疑难”走一遍,覆盖20 µL体系常用参数、熔解曲线判断、胶电泳验证和重设计策略。你照着做,多数二聚体峰能定位。

第一步:快速排查低级错误

教程配图2:qPCR扩增曲线异常引物二聚体 排查流程示意
▲ 教程配图2:qPCR扩增曲线异常引物二聚体 排查流程示意
教程配图3:qPCR扩增曲线异常、引物二聚体排查流程示意
▲ 教程配图3:qPCR扩增曲线异常、引物二聚体排查流程示意

1. 引物终浓度加高了。 10 µM母液各0.8 µL加进20 µL体系,终浓度0.4 µM,NTC容易起晚峰;降到各0.4 µL,终浓度0.2 µM再跑。

2. NTC被污染。 枪头、水、模板气溶胶都会让NTC出Ct;换新滤芯枪头,水现分装,NTC收尾加。

3. 体系没混匀或有气泡。

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