qPCR扩增曲线异常引物二聚体优化

来源:qPCR扩增曲线异常引物二聚体优化(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space

📎 相关工具:论文深度润色

qPCR扩增曲线歪、Ct偏晚、NTC也起峰,十有八九撞上引物二聚体。别急着换酶、换模板,先看低级错误。本文按配液前处理、引物与体系、程序与荧光采集3步拆解,给你现象判断、具体参数和验证动作,SYBR Green和探针法的常见坑都覆盖,照着做能少走两轮无效实验。

第一步:快速排查低级错误

1. 封膜没压紧、板边蒸发:边缘孔Ct晚、曲线低,直接看板边孔。解决:用刮板把每个孔压透,1000×g离心1分钟,别省。

2. 配液气泡没消:曲线锯齿、荧光骤降。解决:离心后别剧烈晃,上机前目检。

3. NTC污染:NTC的Ct<35且熔解峰和样本一致,大概率是移液污染。解决:换枪头、分区配液,NTC最后加。

4. 引物稀释算错:1 OD加水量错10倍,500 nM终浓度能变5 µM。解决:先看管标签,重新稀释到10 µM母液,工作液200-300 nM。

先把这些低级错误过一遍,再往下走。

图2:qPCR扩增曲线异常及引物二聚体优化的排查流程示意
▲ 图2:qPCR扩增曲线异常及引物二聚体优化的排查流程示意

第二步别一上来就改程序。先按实验流程拆模块,判断二聚体到底从

延伸阅读:更多代谢通路设计、多基因组装等合成生物学工具,可访问 DNA Lab Space。

📎 相关文章

qPCR熔解曲线多峰退火温度优化 10-27 细胞复苏存活率低冻存液渗透压 10-27 发酵染菌噬菌体爆发无菌操作排查 10-27 细胞转染毒性大培养基更换时机 10-27