多重PCR偏向性扩增引物平衡

来源:多重PCR偏向性扩增引物平衡(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space

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多重PCR最烦人的不是没条带,是条带一亮一暗。同样的引物,强靶标抢走酶和dNTP,弱靶标就掉队。本文按“先查手误—再拆流程—再攻疑难”的路径,讲透引物平衡:从浓度配比、退火温度、二级结构到模板与循环数,给出能直接照做的体积、温度和时间。别急着重新设计,先把现有体系救回来。

第一步:快速排查低级错误

教程配图2:多重PCR偏向性扩增引物平衡 排查流程示意
▲ 教程配图2:多重PCR偏向性扩增引物平衡 排查流程示意
教程配图3:多重PCR偏向性扩增引物平衡 排查流程示意
▲ 教程配图3:多重PCR偏向性扩增引物平衡 排查流程示意

先别怀疑设计。新手翻车,多半是手误。

  • 引物工作液浓度记错。把100 µM母液当10 µM用,强引物直接翻10倍。解决:100 µM母液取10 µL加90 µL无核酸酶水,得10 µM,涡旋5 s。
  • 模板加错或降解。弱条带组模板浓度只有强组的1/10。解决:测A260/280,1.8-2.0再用;cDNA统一稀释到10 ng/µL。
  • 退火温度照抄单重。多重里强引物在55

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