蛋白纯化峰面积小上样缓冲液调整

来源:蛋白纯化峰面积小上样缓冲液调整(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space

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纯化时最怕UV峰矮一截。上样量没变,峰面积却掉到原来一半,别急着换柱子。峰面积小常常不是仪器坏了,而是样品在上样缓冲液里没“活好”:pH偏了、盐高了、还原剂不够、去垢剂低于CMC,蛋白聚了或没挂柱。本文按样品处理、缓冲液配方、上样洗涤、洗脱检测四段拆排查,给你能直接照做的参数和验证方法,末尾补三个进阶坑。

第一步:快速排查低级错误

1. 上样前没离心或过滤:样品4°C、12000×g离心10 min,再用0.22 µm滤膜过滤,别让沉淀堵柱。

2. 缓冲液pH没校:用校准过的pH计调到目标±0.1;Tris在4°C会漂0.2-0.4,按纯化温度调。

3. 上样体积或浓度记错:核对A280和上样体积,峰面积应与上样蛋白量线性相关;先跑10 µL标准品确认。

4. 柱平衡不够:至少5-10 CV平衡,20 mM Tris pH7.4 + 150 mM NaCl,流速1 mL/min,UV基线平了再上样。

教程配图2:蛋白纯化峰面积小上样缓冲液调整 排查流程示意
▲ 教程配图2:蛋白纯化峰面积小上样缓冲液调整 排查流程示意

上面四条花10分钟就能排掉。别急着改梯度,先把“样品有没有进柱、柱子有没有平衡好”确认清楚。

第二步:分维度系统排查

模块A:样品制备与上样前处理

1. 样品有絮状物,峰面积小且柱压升高

现象:上样后流穿峰大,洗脱峰矮,柱压比平时高0.2-0.5 MPa。原理:聚集蛋白不能结合,还会堵柱。解决:上样缓冲液补到150 mM NaCl、5%甘油、1 mM DTT,4°C静置30 min,12000×g离心10 min;膜蛋白可加0.05% DDM。验证:上样前后A280、SDS-PAGE跑上清和沉淀。

2. 水稀释后峰更小,流穿峰变大

现象:一稀释就浑

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