大肠杆菌表达膜蛋白包涵体去垢剂筛选

来源:大肠杆菌表达膜蛋白包涵体去垢剂筛选(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space

📎 相关工具:蛋白可溶性优化分析

做膜蛋白的都有这个体会:大肠杆菌里表达量挺好,全在包涵体里。好不容易用8M尿素溶解了,一去垢剂就沉淀。超速离心完跑SDS-PAGE,目标条带全在沉淀里,上清干干净净。别急着换载体换菌株,大概率是去垢剂筛选环节出了问题。这篇文章把包涵体溶解、复性稀释、去垢剂种类和浓度、缓冲液条件到检测方法,一条一条拆开讲。每一步给你具体参数和判断标准。

第一步:快速排查低级错误

1. 去垢剂浓度低于CMC。直接看你用的去垢剂浓度是不是在CMC以上2-5倍,DDM的CMC约0.0087%,你用0.1%根本不够,至少1%。

2. 尿素没除干净。残留尿素超过0.5M就会让膜蛋白聚集,透析或稀释后测一下电导率,或者用尿素检测试剂盒确认。

3. 超速离心条件不够。100,000×g至少30分钟,4°C。很多人用12,000×g转15分钟,沉淀不下来的小聚集体全当上清了。

4. pH离等电点太近。膜蛋白在等电点附近溶解度最低,查一下你的蛋白pI,缓冲液pH至少偏离1.5个单位。

教程配图2:大肠杆菌表达膜蛋白包涵体去垢剂筛选 排查流程示意
▲ 教程配图2:大肠杆菌表达膜蛋白包涵体去垢剂筛选 排查流程示意

第二步:分维度系统排查

模块一:包涵体溶解不彻底

现象:8M尿素溶解后,离心管底还有白色絮状物,SDS-PAGE上清里目标条带很弱。

原理:包涵体里膜蛋白和脂质、外膜蛋白混在一起,尿素渗透需要时间。膜蛋白疏水性强,8M尿素有时都搞不定。

解决步骤:

1.

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