包涵体洗涤去膜碎片

来源:包涵体洗涤去膜碎片(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space

📎 相关工具:论文智能降重

开篇导语

收包涵体时,沉淀黄白粘稠,SDS-PAGE 上膜蛋白杂带一堆,目标蛋白却不见纯?大概率是膜碎片没洗掉。别急着上尿素溶解,先看裂解、去垢剂、盐、EDTA、离心条件。本文按实验流程拆成8步,从低级错误到进阶疑难,直接给判断、验证和解决参数,帮你把包涵体洗到更干净。

第一步:快速排查低级错误

1. 菌体没完全重悬就加裂解液。冰上按1 g湿菌加5-10 mL裂解缓冲液,枪头吹打加涡旋30 s,确保无块。

2. 裂解不彻底就离心。超声300 W,工作3 s间歇5 s,冰浴30-50次;或高压均质2-3次,镜检无完整菌再往下走。

3. 初离转速太低。包涵体初离用10,000-12,000×g,4°C,15-20 min;洗涤沉淀用15,000×g,20 min。

4. 洗涤液体积太少。1 g菌泥至少用20-30 mL洗涤液,粘度过高时膜碎片和包涵体分不开。

教程配图2:包涵体洗涤去膜碎片 排查流程示意
▲ 教程配图2:包涵体洗涤去膜碎片 排查流程示意

第二步:分维度系统排查

1. 裂解后粘度像鼻涕,包涵体沉不下来。

现象:离心上清挂壁,沉淀松,膜蛋白杂带多。

原理:DNA/RNA释放,膜碎片密度低,和包涵体共沉。

解决:加DNase I至5-10 µg/mL,MgCl2 2-5 mM,37°C 15 min;或补超声300 W,3 s/5 s,总5-10 min。

验证:上清和沉淀分别跑SDS-PAGE,看目标蛋白是否在沉淀;镜检无完整菌。

2. Triton X-100没洗掉膜,杂带还在。

现象:沉淀黄白粘稠,1% Triton X-100洗后膜蛋白仍多。

原理:Triton去膜需要足够体积和孵育,低温易分层不完全。

解决:1 g湿菌泥加20 mL洗涤液:50 mM Tris pH 8.0,100 mM NaCl,1 mM EDTA,1% Triton X-100,4°C翻转30 min,15,000×g 4°C 20 min,重复2次。

验证:第二次洗涤上清A280低;SDS-PAGE膜蛋白条带减弱。

3. 脱氧胆酸钠浓度过高,包涵体一起溶了。

现象:洗后沉淀变少,目标蛋白跑到上清。

原理:NaDOC比Triton强,>1%或37°C易溶部分包涵体。

解决:用0.5%-1% NaDOC,冰上10-15 min,15,000×g 20 min;目标蛋白丢失就降到0.2%-0.5%。

验证:上清和沉淀分别跑胶,看目标条带分布。

4. EDTA加错时机,膜碎片又回来。

现象:单独用EDTA洗,膜杂带没降。

原理:EDTA螯合Ca2+/Mg2+破坏膜整合,但需和去垢剂联用。

解决:裂解液加1-5 mM EDTA,洗涤液加1 mM EDTA;别和DNase同时高浓度EDTA,会抑制DNase。

验证:对比加和不加EDTA的洗涤后SDS-PAGE。

教程配图3:包涵体洗涤去膜碎片 排查流程示意
▲ 教程配图3:包涵体洗涤去膜碎片 排查流程示意

5. 尿素洗涤把膜和包涵体一起搞散。

现象:2 M尿素洗后沉淀少,杂带仍多。

原理:低浓度尿素剥弱结合蛋白,高浓度或室温会溶包涵体。

解决:0.5-2 M尿素,4°C 10-20 min,15,000×g 20 min;膜碎片多先用Triton/NaDOC,再上尿素。

验证:看上清蛋白量和目标蛋白回收率。

**6. 离心

延伸阅读:更多代谢通路设计、多基因组装等合成生物学工具,可访问 DNA Lab Space。

📎 相关文章

qPCR熔解曲线多峰退火温度优化 10-27 细胞复苏存活率低冻存液渗透压 10-27 细胞转染毒性大培养基更换时机 10-27 细胞划痕实验愈合过快血清浓度降低 10-27