蛋白表达无带稀有密码子

来源:蛋白表达无带稀有密码子(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space

📎 相关工具:论文深度润色

你做诱导表达,SDS-PAGE上目的带没了。诱导泳道跟空载差不多。考染看不见,His抗体也没信号。别急着把锅甩给稀有密码子。先分清是没表达、表达太低、被降解,还是样品根本没进胶。本文按构建序列、宿主菌、诱导条件、样品处理逐段排查,重点讲清稀有密码子成簇、tRNA丰度不足、密码子优化后仍无带怎么处理,参数可直接照做。

第一步:快速排查低级错误

教程配图2:蛋白表达无带稀有密码子 排查流程示意
▲ 教程配图2:蛋白表达无带稀有密码子 排查流程示意
教程配图3:蛋白表达无带稀有密码子 排查流程示意
▲ 教程配图3:蛋白表达无带稀有密码子 排查流程示意
  • 读码框错位:His标签和目的基因不同框,抗体当然抓不到。解决:用序列查看软件从ATG翻译到终止密码子,确认标签连续、没有提前终止。
  • 质粒没转进去或丢了:菌液PCR没条带,诱导半天白忙。解决:新鲜转化,LB加对应抗生素,氨苄100 µg/mL或卡那50 µg/mL,挑单克隆做菌液PCR。
  • 诱导前OD没控好:OD600低于0.4或高于1.2都容易翻车。解决:1:100转接,37°C、220 rpm摇到OD600 0.

延伸阅读:更多代谢通路设计、多基因组装等合成生物学工具,可访问 DNA Lab Space。

📎 相关文章

蛋白洗脱峰拖尾柱床压缩 11-09 发酵种子液活力低活化时间 11-09 核酸qPCR重复性差加样误差 11-09 细胞铺板密度低计数偏差 11-09