TolC蛋白解锁混合连接β-葡聚糖合成:工程菌株产量提升8倍

来源:Microb Biotechnol | 编译:DNA Lab Space

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混合连接β-葡聚糖(MLG)正从实验室 curiosum 走向工业生物制造的前台。这种由β-1,3和β-1,4糖苷键交替连接的多糖,兼具刚性骨架与柔性链段,在食品、医药和材料领域都有想象空间。但产量上不去,一直是其规模化应用的拦路虎。近日,西班牙研究团队在《Microbial Biotechnology》发文,揭示了外膜蛋白TolC在MLG生物合成中的关键角色——它不仅是合成机器的核心部件,更是产量跃升的开关。通过共表达tolC、bgsBA和组成型活性二鸟苷酸环化酶,研究者将MLG产量推高至约10 g/L,并在非天然产MLG的根瘤菌宿主中实现了从无到有的合成。这项发现为MLG的工业化生产提供了清晰的工程路径。

研究背景

MLG是一类由β-1,3和β-1,4糖苷键混合连接而成的线性葡聚糖,广泛存在于禾本科植物细胞壁和某些细菌胞外多糖中。与纯β-1,4连接的纤维素或纯β-1,3连接的酵母葡聚糖不同,MLG的混合连接模式赋予其独特的流变学特性——它能形成热可逆凝胶,且凝胶强度与连接比例密切相关。这些性质使MLG在食品增稠剂、膳食纤维补充剂和生物材料领域具有开发价值。

在细菌中,MLG的合成研究主要集中于根瘤菌。此前工作已明确,MLG生物合成受第二信使环二鸟苷酸(c-di-GMP)调控,由双顺反子操纵子bgsBA介导。BgsA是糖基转移酶,负责多糖链的延伸;BgsB则被认为是膜相关蛋白,可能参与聚合物的转运或组装。然而,完整的合成机器构成一直存在盲区——BgsA和BgsB是否足以完成合成与分泌?是否还有其他蛋白参与?这些问题悬而未决。

TolC是革兰氏阴性菌中典型的outer membrane factor(OMF)家族蛋白,通常与内膜转运体形成三组分外排泵复合物,负责将底物泵出细胞外。在MLG合成中,TolC是否也扮演类似角色?本研究正是从这个疑问出发,系统考察了TolC在苜蓿中华根瘤菌(Sinorhizobium meliloti)MLG合成中的作用,并基于此构建了高产工程菌株。

研究方法

研究团队以苜蓿中华根瘤菌8530为出发菌株,系统开展了基因敲除、互补表达和共过表达实验。整个技术路线清晰:先构建tolC缺失突变体,验证其对MLG合成的影响;再通过回补实验确认表型;最后构建多基因共表达模块,在摇瓶和生物反应器两个尺度评估产量。

菌株与培养条件

供试菌株包括苜蓿中华根瘤菌、日本中生根瘤菌(Mesorhizobium japonicum)和菜豆根瘤菌(Rhizobium etli)。常规培养采用添加3.40 mM CaCl₂·2H₂O的胰蛋白胨-酵母提取物培养基(TY),或最小培养基(MM)。MM配方为(每升):甘露醇10 g、谷氨酸钠1.1 g、KH₂PO₄ 0.3 g、K₂HPO₄ 0.3 g、MgSO₄·7H₂O 0.15 g、CaCl₂·2H₂O 0.05 g、FeCl₃ 0.006 g、NaCl 0.05 g,另加1 mL 1000×维生素储备液(含生物素0.2 g/L、盐酸硫胺素0.1 g/L、泛酸钠0.1 g/L)。苜蓿中华根瘤菌和日本中生根瘤菌在28°C培养,菜豆根瘤菌在30°C培养。用于克隆和接合转移的大肠杆菌在37°C LB培养基中培养。

抗生素使用浓度:四环素(Tc)10 μg/mL(菜豆根瘤菌用5 μg/mL)、卡那霉素(Km)50 μg/mL、刚果红(CR)50 μg/mL、荧光增白剂(CF)200 μg/mL、IPTG 1 mM。所有质粒通过大肠杆菌β2163或S17.1供体菌株接合转移导入根瘤菌。

tolC基因敲除与回补

采用同源重组策略在苜蓿中华根瘤菌8530中构建tolC框内缺失突变体。敲除片段经PCR验证,确认无残留基因片段。回补实验将完整tolC基因克隆至广宿主质粒,通过接合转移导入突变体,恢复其表达。

MLG产量测定

MLG定量采用地衣多糖酶(lichenase)消化法,测定释放的葡萄糖当量。具体而言,根瘤菌在100 mL锥形瓶(含20 mL液体MM培养基,添加适宜浓度Tc)中培养3天,摇床转速170 rpm,苜蓿中华根瘤菌28°C、菜豆根瘤菌30°C。初始OD₆₀₀调至0.05。培养结束后,样品经地衣多糖酶处理,释放的葡萄糖用葡萄糖氧化酶法测定,换算为MLG产量。

多基因共表达模块构建

为提升MLG产量,研究团队构建了包含tolC、bgsBA和组成型活性二鸟苷酸环化酶基因(pleD)的多基因表达模块。pleD编码的突变型地苷酸环化酶持续产生c-di-GMP,解除内源调控对MLG合成的限制。共表达模块克隆至广宿主质粒,通过接合转移导入不同根瘤菌宿主。对照质粒不含tolC,用于评估TolC对产量的独立贡献。

生物反应器放大实验

在摇瓶验证的基础上,研究团队进行了生物反应器放大实验。反应器条件原文摘要未详述具体参数,但明确提及在生物反应器条件下MLG产量可达约10 g/L。

三突变体构建

为排除其他c-di-GMP调控胞外多糖(EPS)对MLG产量的竞争影响,研究者构建了三重突变体IBR606,依次敲除wgcA(EPS II合成基因)、exoY(EPS I合成基因)和uxs1-uxe(APS合成基因)。突变依次引入,每步均经PCR确认基因型,并通过表型观察确认相应EPS缺失。

研究结果

TolC缺失完全 abolish MLG合成

这是本研究的核心发现。在苜蓿中华根瘤菌中敲除tolC后,MLG合成完全消失。回补完整tolC基因后,MLG产量恢复。这一结果清晰表明,TolC是MLG生物合成机器不可或缺的组成部分。研究者据此提出,TolC可能与BgsA、BgsB形成三组分复合物,协同完成聚合物的合成和/或分泌。这一模型与TolC在外排泵系统中的经典功能相呼应——在革兰氏阴性菌中,TolC作为外膜通道,与内膜转运体形成跨膜通道,将底物泵出细胞。在MLG合成中,TolC可能扮演类似角色,为正在延伸的多糖链提供跨外膜的出口。

共表达模块实现产量8倍提升

在确认TolC必要性的基础上,研究者构建了共表达模块。将tolC、bgsBA和pleD*共同过表达,MLG产量较不含tolC的对照质粒提升了8倍。这一数据明确量化了TolC对产量的贡献——它不仅是合成所必需,更是限速因素之一。在生物反应器条件下,该模块的MLG产量达到约10 g/L。这一数值在细菌胞外多糖生产中属于较高水平,表明该工程模块具备规模化应用潜力。

模块可移植性验证

将上述遗传模块导入日本中生根瘤菌——该菌天然不产MLG——成功实现了MLG的从头合成。这一结果证明,该模块具有跨菌种的可移植性,可作为合成生物学工具包在不同根瘤菌底盘间转移。这种"即插即用"的特性为MLG生产菌株的多样化选择提供了可能,也为未来在其他微生物中重构MLG合成途径奠定了基础。

三重突变体对MLG产量无显著影响

为探究其他c-di-GMP调控EPS是否与MLG竞争碳通量,研究者构建了敲除EPS I、EPS II和APS合成基因的三重突变体IBR606。结果表明,在生理c-di-GMP水平下,野生型MLG产量低于检测限,IBR606背景中亦无显著增加。当携带pleD*质粒提高c-di-GMP水平后,IBR606的MLG产量略高于野生型,但差异无统计学意义。这一结果排除了其他EPS对MLG产量的竞争性抑制,说明MLG合成的主要限制因素在于c-di-GMP水平和TolC/BgsBA的表达量,而非碳通量在不同EPS途径间的分配。

TolC is required for MLG production. (A) Plasmid structure of pJBpleD*9091 and its derivative pJBpleD*9091C overexpressing tolC , constructed in this work. (B) Quantification of MLG production in S. meliloti 2011 and their tolC mutant derivative. MLG levels were measured in the wild‐type strains and
▲ TolC is required for MLG production. (A) Plasmid structure of pJBpleD*9091 and its derivative pJBpleD*9091C overexpressing tolC , constructed in this work. (B) Quantification of MLG production in S. meliloti 2011 and their tolC mutant derivative. MLG levels were measured in the wild‐type strains and

关键数据汇总

  • tolC缺失:MLG合成完全消失
  • tolC回补:MLG产量恢复
  • 共表达tolC+bgsBA+pleD*:MLG产量较对照(无tolC)提升8倍
  • 生物反应器条件:MLG产量约10 g/L
  • 日本中生根瘤菌(非天然产MLG宿主):实现MLG从头合成
TolC overexpression increases MLG yields in S. meliloti . (A) MLG production was quantified in the S. meliloti 8530 Δ bgsBA background harbouring pJB3Tc19, pJBpleD*9091, or pJBpleD*9091C plasmids. Data were normalized to total protein content and represent the mean ± SD from five independent experim
▲ TolC overexpression increases MLG yields in S. meliloti . (A) MLG production was quantified in the S. meliloti 8530 Δ bgsBA background harbouring pJB3Tc19, pJBpleD*9091, or pJBpleD*9091C plasmids. Data were normalized to total protein content and represent the mean ± SD from five independent experim

讨论与展望

TolC的发现补齐了MLG生物合成机器的关键拼图。此前研究聚焦于BgsA和BgsB,但两者是否足以支撑完整的多糖合成与分泌,始终缺乏直接证据。本研究通过遗传学手段证明TolC不可或缺,并提出了三组分复合物的结构模型。这一模型与革兰氏阴性菌中经典的"内膜转运体-周质衔接蛋白-外膜通道"三组分外排泵架构高度一致,提示MLG合成可能采用了类似的跨膜分泌机制。

从应用角度看,8倍产量提升和10 g/L的产量水平具有明确工业价值。更为重要的是,该模块的跨菌种可移植性为合成生物学提供了标准化的"MLG合成工具箱"。未来若能在其他工业微生物(如大肠杆菌或芽孢杆菌)中重构该途径,或通过启动子工程和蛋白工程进一步优化各组分表达比例,产量有望进一步提升。原文摘要未详述生物反应器的具体工艺参数,包括发酵时间、补料策略和溶氧控制等,这些信息对工业化放大至关重要,值得在后续研究中补充。

一个值得注意的细节是,三重突变体实验排除了其他EPS对MLG产量的竞争效应,但并未考察这些EPS是否在菌株适应性或多糖质量方面存在间接影响。此外,TolC-BgsA-BgsB复合物的原子结构尚未解析,其组装机制和底物识别方式仍待阐明。这些基础问题既是理解MLG生物合成的关键,也是理性工程化改造的前提。

Effect of other c‐di‐GMP‐regulated EPS on MLG production. Quantification of MLG in (A) Sinorhizobium meliloti 8530 (WT) and the triple mutant IBR606 (Δ wgcA Δ exoY Δ uxs1‐uxe ) carrying either the control plasmid pJB3Tc19 or pJBpleD*, and (B) Rhizobium etli CFN42 (WT) and the Δ celAB mutant carrying
▲ Effect of other c‐di‐GMP‐regulated EPS on MLG production. Quantification of MLG in (A) Sinorhizobium meliloti 8530 (WT) and the triple mutant IBR606 (Δ wgcA Δ exoY Δ uxs1‐uxe ) carrying either the control plasmid pJB3Tc19 or pJBpleD*, and (B) Rhizobium etli CFN42 (WT) and the Δ celAB mutant carrying

参考来源

Ruiz-Sáez L, Pacheco PJ, Peinado J, Lloret J, Muñoz S. TolC Is Required for a Mixed-Linkage β-Glucan (MLG) Biosynthesis: Engineering Bacteria for MLG Overproduction. Microbial Biotechnology. PMID: 42552791.

PMID: 42552791

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