Cas调节靶向嵌合体

来源:Nucleic Acids Res | 编译:DNA Lab Space

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CRISPR/Cas12a系统因其独特的高特异性与顺式切割能力,在基因编辑与分子诊断中备受青睐,但活性一旦失控便会引发脱靶效应。针对这一问题,研究人员设计了一种名为Cas-regulation-targeting chimera的嵌合核酸分子,能够选择性地结合Cas12a蛋白,并通过模块化效应元件实现活性的精确、可逆调控。该策略为CRISPR工具的可控化提供了全新思路。

研究背景

CRISPR/Cas12a是继Cas9之后被广泛应用的第三代基因编辑工具,它由Cas12a核酸酶和CRISPR RNA(crRNA)组成,在识别富含胸腺嘧啶的PAM序列后,能够完成靶双链DNA的顺式切割,并进一步释放非特异性单链DNA切割活性。相比Cas9,Cas12a具有更高的靶向特异性,且能够处理富含AT的基因组区域,因此在基因治疗、农作物改良以及快速核酸检测等领域展现出巨大潜力。

然而,Cas12a作为一种持续发挥催化活性的核酸酶,在进入细胞后缺少“刹车”机制。无论是基础研究中的基因功能解析,还是临床转化中的体内编辑,都面临一个共同的难题:如何在时间、空间和剂量水平上精确控制Cas12a的活性。过量或过久的编辑活性会提高脱靶突变风险,引起DNA损伤应答甚至细胞死亡。已有的调控策略包括split-Cas12a拆分体系、光遗传学干预、小分子诱导系统以及天然anti-CRISPR蛋白等。这些方法虽然有效,但普遍存在组件过多、递送复杂、响应缓慢或不可逆等局限。尤其缺乏一种能够在同一分子支架内实现激活/抑制相互切换,并且对不同Cas蛋白具有高选择性的通用调控工具。

正是在这一背景下,研究者提出构建一种“Cas调节靶向嵌合体”,通过一个单分子同时完成对Cas12a蛋白的特异性识别和功能调节,从而实现对Cas12a活性的按需控制。

研究方法

该研究采用了一种模块化设计策略,将“靶向模块”与“效应模块”整合到同一嵌合分子中。整个技术路线可概括为:识别适配体筛选 → 模块化组装 → 体外结合验证 → 细胞内功能

Regulation of LbCas12a activity by phosphorothioate-anchored nucleic acids. ( A ) Schematic illustration of psDNA-mediat
▲ Regulation of LbCas12a activity by phosphorothioate-anchored nucleic acids. ( A ) Schematic illustration of psDNA-mediat
Mechanistic insights of psDNA-mediated regulation of LbCas12a activity. ( A ) Workflow of Cas12a-mediated DNA cleavage.
▲ Mechanistic insights of psDNA-mediated regulation of LbCas12a activity. ( A ) Workflow of Cas12a-mediated DNA cleavage.
Selective regulation of LbCas12a activity in multi-enzyme system. Real-time fluorescence curves showing the regulation o
▲ Selective regulation of LbCas12a activity in multi-enzyme system. Real-time fluorescence curves showing the regulation o

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