硫辛酸三硫化物介导的HGF工程化改造

来源:Sci Rep | 编译:DNA Lab Space

硫辛酸三硫化物介导的HGF工程化改造:增强受体亲和力与抗硝化失活能力
研究概览图

导语

肝细胞生长因子(HGF)在组织再生与修复中扮演关键角色,但其临床应用受限于受体亲和力不足及病理环境下易发生硝化失活。近日,Zushi等人在《Scientific Reports》发表研究,报道了一种基于硫辛酸三硫化物(LATS)相互作用的HGF改造策略。改造后的HGF变体不仅对c-Met受体的亲和力显著增强,还获得了抵抗活性氮硝化所致功能丧失的能力,为HGF的合成生物学优化与治疗应用开辟了新途径。

研究背景

HGF是一种多效性细胞因子,通过与细胞膜上的c-Met受体结合,激活下游Ras/MAPK、PI3K/Akt及STAT等信号通路,在肝脏再生、肾小管修复、皮肤创伤愈合及血管新生等过程中发挥重要的促分裂、抗凋亡和形态发生作用。然而,天然HGF的临床应用面临两大瓶颈:其一,HGF与c-Met的固有亲和力有限,尤其在低受体密度组织中难以充分激活信号;其二,损伤或炎症微环境中常伴随大量一氧化氮(NO)与超氧阴离子的生成,导致蛋白质酪氨酸残基发生3-硝基酪氨酸修饰(即硝化),进而严重损害HGF的受体结合能力与生物学活性。因此,如何在不显著改变蛋白结构的前提下,同时提升HGF的受体亲和力与抗硝化能力,是合成生物学与蛋白质工程领域亟待解决的问题。

硫辛酸是一种天然存在的含二硫键五元环化合物,具有可逆氧化还原特性,其衍生物硫辛酸三硫化物(lipoic acid trisulfide, LATS)含有一个三硫键,被认为可通过硫-硫相互作用与蛋白质半胱氨酸残基发生动态共价连接。该团队设想,若将LATS定向引入HGF分子中特定半胱氨酸附近,可能通过多重硫键相互作用稳定HGF的活性构象,增强其与受体的结合,并可能屏蔽酪氨酸位点免受活性氮攻击。

研究方法

1. HGF变体的理性设计与基因构建

研究者首先通过分子动力学模拟,分析了HGF α链N端结构域(N-domain)与c-Met受体结合界面的构象动态。根据自由能微扰计算,确定了HGF第87位半胱氨酸(C87)附近是一个对构象稳定敏感的区域,且该位点毗邻关键的受体结合环。团队设计了一种合成生物学改造策略:在C87侧链引入一个含有空间邻近巯基的柔性连接臂,使其能够与LATS的三硫键发生硫-二硫交换反应,形成稳定的混合二硫键加合物。利用基因合成技术,克隆得到HGF的编码基因,并通过定点突变在C87所在环区插入带有游离半胱氨酸的短肽标签(Gly-Gly-Cys-Gly),得到HGF-Cys*变体。同时,构建了野生型HGF和标签无半胱氨酸的对照组。所有基因均克隆至带有CMV启动子的哺乳动物表达质粒中,以人胚肾293F细胞进行分泌表达。

2. 硫辛酸三硫化物加合物的制备与纯化

在化学偶联方面,研究者合成了LATS,并通过高效液相色谱(HPLC)确认纯度>95%。将表达并纯化后的HGF-Cys*蛋白在pH 7.4的磷酸盐缓冲液中与100 μM LATS于25℃反应2小时,利用标签半胱氨酸侧链亲核进攻LATS的三硫键,发生硫-硫交换,形成HGF-LATS共价加合物。反应混合物使用分子排阻色谱去除未反应的LATS,并借助质谱验证每个蛋白分子上平均引入的LATS数目为0.9±0.1个,表明位点选择性良好。最终得到工程化改造的HGF-LATS变体。

3. 受体亲和力与活性测定方法

采用表面等离子体共振(SPR)技术,将重组人c-Met胞外域固定于CM5芯片上,分别流过不同浓度的野生型HGF、HGF-Cys*及HGF-LATS,实时监测结合-解离曲线,并用1:1 Langmuir模型拟合动力学常数。细胞水平的功能验证使用人肝细胞系HepG2和肾小管上皮细胞HK-2进行。细胞在无血清条件下经各HGF变体处理后,以免疫印迹检测c-Met磷酸化(Tyr1234/1235)及下游Akt和ERK1/2磷酸化水平。同时,通过MTS法测定细胞增殖,划痕试验评估迁移能力。

4. 抗硝化能力的评估

为模拟体内硝化微环境,将各HGF变体与过氧亚硝酸盐(ONOO⁻)供体SIN-1在37℃孵育1小时,后通过Western blot使用抗3-硝基酪氨酸抗体检测硝化修饰程度,并通过上述SPR与磷酸化实验检验硝化处理后的受体结合与信号激活能力。此外,通过液质联用(LC-MS/MS)鉴定具体的硝化位点。

研究结果

1. HGF-LATS的受体亲和力显著提升

SPR分析结果显示,野生型HGF与c-Met的平衡解离常数(KD)为3.2±0.4 nM,而HGF-LATS的KD达到0.8±0.1 nM,亲和力提高了约4倍。HGF-Cys*组KD为2.9±0.5 nM,与野生型无显著差异,排除了半胱氨酸标签本身的影响。动力学拆分显示,亲和力增加主要来源于解离速率(koff)的降低——HGF-LATS的koff值为2.1×10⁻⁴ s⁻¹,仅为野生型的1/3.5,提示LATS加合物可能通过构象锁定效应延长了配体-受体复合物的寿命。

2. 信号激活与细胞功能进一步增强

在HepG2细胞中,10 ng/mL HGF-LATS触发的c-Met磷酸化信号强度为野生型HGF的2.8倍,且达到半数最大效应的有效浓度(EC50)由6.5 ng/mL降至1.7 ng/mL。下游Akt和ERK1/2磷酸化亦呈现类似趋势,表明信号级联的放大贯穿整条通路。功能实验中,HGF-LATS促进HepG2细胞增殖的效能提高约40%,在HK-2细胞划痕修复中的伤口闭合速率较野生型HGF处理组加快了1.6倍。这些结果充分证明,受体亲和力的增强转化为更高效的生物学功能输出。

3. 获得对硝化失活的显著抗性

SIN-1处理后,野生型HGF的受体结合能力几乎完全丧失(KD难以测出),伴随酪氨酸硝化水平急剧上升,质谱鉴定到N-domain的Tyr24、Tyr27和Tyr131等多个位点发生3-硝基酪氨酸修饰。与之形成鲜明对比,HGF-LATS仅表现出轻度结合能力下降(KD从0.8 nM增至1.5 nM),且硝化位点数量大幅减少,尤其是Tyr24的硝化丰度降低了约85%。在细胞信号检测中,硝化后的野生型HGF几乎不能激活c-Met磷酸化,而HGF-LATS仍保持约70%的信号激活能力。结构性分析提示,LATS的引入可能在空间上遮蔽了敏感酪氨酸残基,抑制了活性氮的进攻;同时,LATS-S-S键的动态可逆性可能作为一种“牺牲型陷阱”,优先与过氧亚硝酸盐反应,从而保护了蛋白质关键残基。

4. 构象稳定性与分子机制解析

圆二色光谱和差示扫描荧光测定表明,HGF-LATS的熔融温度(Tm)较野生型提高了4.8℃,表明整体构象更为稳定。分子动力学模拟显示,LATS通过三硫键与连接臂半胱氨酸相连后,其环状结构与N-domain表面的疏水斑块形成额外的范德华接触,并进一步通过与受体结合环上的丝氨酸残基形成氢键,稳定了“闭合-活性”构象。这种构象锁定一方面降低了结合熵惩罚,提升了受体亲和力,另一方面通过遮挡酪氨酸侧链,减少了溶剂可及表面积,从而实现了抗硝化的多重保护效应。

讨论与展望

该研究巧妙地将合成生物学概念与定点化学修饰相结合,构建了一种兼具高亲和力与强抗化学失活能力的HGF变体。与传统蛋白质工程中依赖氨基酸替换的策略不同,此方法利用LATS的可逆共价相互作用,动态地“加固”蛋白质关键功能域,有望避免永久性突变带来的结构扰动或免疫原性风险。此外,这种基于二硫化/多硫化物的构象锁定策略很可能具有普适性,可拓展至其他具有关键半胱氨酸的功能蛋白,如EGF、FGF等生长因子家族,为再生医学领域提供通用的蛋白质稳定性优化方案。

然而,该技术距离临床应用仍需解决若干问题。LATS在体内的代谢稳定性、HGF-LATS的免疫原性以及长期使用的安全性需要系统性评估。后续研究可采用更加生物正交的化学手柄,或将LATS加载模块编码到基因回路中,通过合成生物学手段实现细胞自主合成与修饰,从而提供时空可控的活性蛋白制剂。总体而言,这项工作不仅为HGF的合成生物学改造提供了新范例,也为理解多硫化物在蛋白质稳态调控中的功能开辟了新视角。

参考来源

Zushi K, Seki M, Mizuochi R, Shitamitsu K, Elgaabari A. Enhanced HGF with increased receptor affinity and nitration-dysfunction resistance through interaction with lipoic acid trisulfide. *Sci Rep*, 2026, 16(1): 23545. DOI: 10.1038/s41598-026-60835-w.

DOI: 10.1038/s41598-026-60835-w

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