真菌漆酶驱动二氢二苯乙烯与菲类骨架重构

来源:ACS Omega | 编译:DNA Lab Space

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天然产物的结构多样性,决定了其生物活性的丰富程度。如何高效、绿色地制造这种多样性,一直是药物筛选领域的核心命题。瑞士日内瓦大学的研究团队近期给出了一份漂亮的答卷——他们利用变色栓菌来源的漆酶,对三种植物来源的芳香族化合物进行生物转化,一次性分离出13种结构各异的衍生物,其中10种为全新化合物。这项工作发表在《ACS Omega》上。

研究背景

天然产物长期以来是药物发现的重要源泉,但自然界提供的骨架终究有限。化学合成虽然能扩展结构空间,却往往涉及有毒试剂和多步反应,与绿色化学的理念相悖。生物转化——利用酶或微生物催化底物发生结构修饰——提供了一个折中方案:反应条件温和、选择性好、环境友好。

在众多生物转化工具酶中,漆酶(laccase)格外引人注目。这种含铜氧化酶能催化酚类底物的单电子氧化,生成反应活性极高的自由基中间体。这些中间体随后可发生偶联、加成等非酶促反应,从而创造出结构远比底物复杂的产物。此前,漆酶介导的转化已在多种化学类型中成功获得生物活性化合物。

本研究的焦点是三类结构相近但氧化程度不同的底物:二氢二苯乙烯类化合物gigantol(1),以及菲类化合物flavidin(2)和coelonin(3)。这些化合物均来自兰科植物,具有潜在的药理活性,但其漆酶介导的生物转化此前未见系统研究。研究者选择变色栓菌(Trametes versicolor)来源的漆酶作为催化剂,试图探索这些底物在酶促氧化条件下能产生怎样的结构多样性。

研究方法

材料与仪器配置

三种底物均购自商业渠道。Gigantol(CAS: 83088-28-2)购自法国Extrasynthese公司;flavidin(CAS: 83924-98-5)和coelonin(CAS: 82344-82-9)购自中国湖北ChemFaces公司。变色栓菌漆酶(CAS: 80498-15-3)购自德国Merck公司。

结构鉴定依赖两台核心仪器。紫外光谱由HACH UV–vis DR/4000分光光度计记录。核磁共振数据在配备QCI 5 mm低温探头和SampleJet自动进样系统的Bruker Avance Neo 600 MHz谱仪上采集,以残余DMSO-d6信号(δH 2.50;δC 39.5)为内标,化学位移以ppm(δ)表示,偶合常数(J)以Hz为单位。完整的结构归属基于COSY、ROESY、HSQC和HMBC等二维核磁实验。

分析尺度生物转化反应

反应在2 mL Eppendorf管中进行,每管只处理一种底物。反应总体积为0.5 mL。底物先用乙醇溶解,终浓度为1 mg/mL,即每管含500 μg底物。漆酶最后加入,用量为30 μL、浓度12.5 U/mL的水溶液。

反应体系的溶剂组成经过精心设计:乙醇占比10%,丙酮最高可达60%,水占30%至90%(体积比)。配制完成后,混合物在室温、避光条件下持续轻微振荡。反应3至9小时后,用500 μL乙酸乙酯萃取反应介质。有机相在氮气流下干燥,最终溶于200 μL甲醇,供超高效液相色谱分析。

条件优化与放大

小型转化实验旨在考察不同条件下底物的反应活性。研究者测试了10%至70%的有机溶剂浓度范围和10至100 U/mL的漆酶储备液浓度范围。反应进程通过UHPLC-PDA-ELSD-MS监测——具体而言,是观察底物信号是否显著下降、质谱基峰强度(BPI)色谱图中是否出现多个新峰。

放大反应采用20至50 mg底物,反应体积5至10 mL,监测条件与分析尺度相同。待底物消耗完全后终止反应,粗混合物经高效半制备液相色谱纯化,采用干法上样(dry-load injection)技术。分离得到的衍生物随后进行详细的波谱学分析,以实现 unambiguous 的结构确证。

研究结果

Gigantol的转化产物

在gigantol(1)的生物转化条件筛选中,30%有机溶剂、30 μL浓度12.5 U/mL的漆酶溶液、室温孵育9小时的组合产生了最丰富的质谱特征峰。这些信号对应三类衍生物:羟基化产物(m/z 291 [M+H]+)、乙基化产物(m/z 319 [M+H]+)以及gigantol的二聚体(m/z 545–549 [M+H]+)。

主要化合物4和5在几乎所有测试条件下都能观察到,另有6至9等次要衍生物伴随产生。值得注意的是,gigantol始终未被完全转化——即便在优化条件下,底物信号依然存在。

当缩短孵育时间并提高漆酶浓度时,反应路径发生了有趣的变化:一些次要衍生物减少,取而代之的是12和13这两个不寻常的化合物。这表明反应条件的微调能改变产物的分布格局。

产物分离与结构鉴定

经过条件优化和放大反应,研究团队从三种底物的转化混合物中分离出13种结构多样的衍生物。经高分辨质谱(HRMS)和核磁共振波谱综合表征,其中10种化合物被确认为首次报道的新化合物。这些产物涵盖单体、二聚体乃至三聚体——不同聚合程度的产物共存于同一反应体系中,反映出漆酶催化产生的自由基中间体具有多种偶联路径。

(A)利用云芝漆酶在分析规模下对gigantol(1)进行生物转化过程及UHPLC-MS分析。(B)利用云芝漆酶放大gigantol的生物转化过程,并通过半制备型HPLC-UV分离生成的化合物。使用BioRender.com图标创建。
▲ (A)利用云芝漆酶在分析规模下对gigantol(1)进行生物转化过程及UHPLC-MS分析。(B)利用云芝漆酶放大gigantol的生物转化过程,并通过半制备型HPLC-UV分离生成的化合物。使用BioRender.com图标创建。

反应条件的调控效应

有机溶剂比例是一个关键变量。研究者测试了10%至70%的有机溶剂浓度范围,发现溶剂组成显著影响转化效率和产物分布。漆酶浓度同样具有调控作用——10至100 U/mL的储备液浓度范围内,高浓度漆酶配合短时间孵育能诱导非常规衍生物的产生。

白烛葵醚(gigantol,1)、黄柄曲霉素(flavidin,2)和辅酶灵(coelonin,3)经生物转化获得的分离衍生物。所示百分比对应分离产物产率,以起始底物初始质量为基础计算。
▲ 白烛葵醚(gigantol,1)、黄柄曲霉素(flavidin,2)和辅酶灵(coelonin,3)经生物转化获得的分离衍生物。所示百分比对应分离产物产率,以起始底物初始质量为基础计算。

反应时间从3小时到9小时不等。延长孵育时间有利于主要产物的积累,而缩短时间则可能捕获动力学控制的中间产物。室温条件和避光处理保证了反应的可重复性。

图1 化合物3的HMBC谱图,显示所有观察到的相关信号。
▲ 图1 化合物3的HMBC谱图,显示所有观察到的相关信号。

底物依赖的转化行为

三种底物虽然结构相似,但转化行为各有特点。Gigantol的转化最为复杂,产生了包括二聚体在内的多种衍生物;flavidin和coelonin作为菲类化合物,其转化产物中同样检测到寡聚物。这些差异可能源于底物分子上酚羟基的位置和数量不同,影响了自由基的稳定性和偶联位点。

讨论与展望

这项研究的意义在于方法学层面。漆酶介导的生物转化并非新概念,但将其系统应用于二氢二苯乙烯和菲类骨架,并成功分离出多种新化合物,这本身就拓展了天然产物结构空间的边界。10个新化合物的发现比例相当可观——13个分离产物中,超过四分之三是首次报道。

从实用角度看,该工作流程具有明显优势。反应条件温和(室温、常压、水相为主),催化剂是商业化酶制剂,无需工程菌株或辅因子再生体系。干法上样的半制备液相色谱有效解决了粗提物中极性差异大、易拖尾的分离难题。

当然,这项研究也有未展开的面向。论文摘要未详述13个化合物的具体生物活性数据,也未涉及产物的立体化学细节。漆酶催化偶联反应的区域选择性和对映选择性控制,通常是这类转化面临的共性挑战——但原文未提供相关讨论,这里不做推测。

一个值得注意的观察是gigantol始终无法被完全转化。这究竟是底物抑制、产物反馈抑制还是反应平衡所致,原文未给出明确解释。若后续研究能阐明这一现象的机制,或许能通过调整加酶方式或分批补料策略实现更彻底的转化。

总体而言,这项研究为天然产物衍生化提供了一个高效、绿色的工具箱。真菌漆酶介导的生物转化,有望在药物筛选前期的化合物库构建中发挥更大作用——尤其是对于那些化学合成难度大、但具有良好生物活性的植物源骨架。

参考来源

Favre-Godal Q, Marcourt L, Giraud M, et al. Laccase-Catalyzed Biotransformation of Dihydrostilbenes and Phenanthrenes: A Route to Novel Natural Product Derivatives. ACS Omega, 2025. PMID: 42495288.

PMID: 42495288

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