破解MLG生物合成“拼图”的最后一块

来源:Microb Biotechnol | 编译:DNA Lab Space

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混合连接β-葡聚糖(MLG)因其独特的结构流变学特性,正成为合成生物学领域备受关注的生物聚合物。然而,其生物合成机制中仍有一块关键拼图缺失——负责聚合物合成与分泌的完整分子机器究竟由哪些组分构成?一项发表于《Microbial Biotechnology》的最新研究给出了出人意料的答案:外膜蛋白TolC竟在其中扮演不可或缺的角色。该研究不仅揭示了TolC与BgsA、BgsB形成三组分复合物共同完成MLG合成与转运的新机制,还通过共过表达策略将MLG产量推高至生物反应器条件下的约10 g/L,并在非天然产MLG的根瘤菌宿主中实现了从无到有的异源合成。

研究背景

MLG是一类由β-1,3和β-1,4糖苷键交替连接而成的线性多糖,广泛存在于禾本科植物细胞壁及部分细菌胞外分泌物中。在细菌中,尤其是根瘤菌属,MLG的生物合成受第二信使环二鸟苷酸(c-di-GMP)的严格调控,并由双顺反子操纵子bgsBA介导。已有的研究表明,BgsA负责糖基转移酶活性,BgsB则可能参与聚合物的跨膜转运。然而,完整的生物合成机器组成——特别是聚合物如何高效跨越外膜分泌至胞外——以及如何进一步提升产量的策略,始终是悬而未决的问题。这一瓶颈限制了MLG作为可降解生物材料、膳食纤维及医药载体等应用场景的规模化生产。

研究方法

菌株与培养条件

研究团队使用了多种根瘤菌作为研究对象,包括苜蓿中华根瘤菌(Sinorhizobium meliloti)、日本中生根瘤菌(Mesorhizobium japonicum)以及菜豆根瘤菌(Rhizobium etli)。常规培养采用添加3.40 mM CaCl₂·2H₂O的胰蛋白胨-酵母提取物培养基(TY)或最小培养基(MM)。MM培养基每升含:10 g甘露醇、1.1 g谷氨酸钠、0.3 g KH₂PO₄、0.3 g K₂HPO₄、0.15 g MgSO₄·7H₂O、0.05 g CaCl₂·2H₂O、0.006 g FeCl₃、0.05 g NaCl,并补加1 mL的1000×维生素储备液(含0.2 g/L生物素、0.1 g/L盐酸硫胺素和0.1 g/L泛酸钠)。S. melilotiM. japonicum菌株在28°C培养,R. etli在30°C培养。用于克隆和接合转移的大肠杆菌在37°C的LB培养基中培养。

抗生素及筛选试剂的使用浓度如下:四环素(Tc)10 μg/mL(R. etli为5 μg/mL)、卡那霉素(Km)50 μg/mL、刚果红(CR)50 μg/mL、荧光增白剂(CF)200 μg/mL、IPTG 1 mM。所有质粒均通过大肠杆菌β2163或S17.1供体菌株接合转移导入根瘤菌。

三突变体构建

为探究其他c-di-GMP调控型胞外多糖对MLG产量的影响,研究团队在S. meliloti 8530中构建了三重突变体。通过框内缺失依次敲除了三个基因:wgcA(负责EPS II合成)、exoY(负责EPS I合成)以及uxs1-uxe(负责APS合成)。每步突变均通过PCR进行遗传水平验证,并通过相应EPS表型缺失进行微生物学确认。最终获得的三重突变体命名为IBR606。

MLG定量检测

MLG产量通过地衣多糖酶(lichenase)消化后测定释放的葡萄糖当量来量化。具体操作:将根瘤菌接种于含100 mL三角瓶的20 mL液体MM培养基中(补加适宜浓度的Tc),S. meliloti菌株于28°C、R. etli菌株于30°C条件下,170 rpm振荡培养3天。初始OD₆₀₀调整为0.05。

过表达模块构建

为提升MLG产量,研究团队构建了包含tolCbgsBA以及组成型活性二鸟苷酸环化酶基因pleD\的共过表达模块。其中,pleD\通过表达组成型活性的二鸟苷酸环化酶提高胞内c-di-GMP水平,从而激活MLG合成通路。对照质粒不含tolC,用于评估该基因对产量的独立贡献。

生物反应器发酵

在摇瓶验证的基础上,研究团队进一步在生物反应器条件下评估了最优菌株的MLG产量。原文摘要未详述反应器的具体型号、工作体积、搅拌转速、通气量及pH控制策略等参数。

Effect of other c‐di‐GMP‐regulated EPS on MLG production. Quantification of MLG in (A) Sinorhizobium meliloti 8530 (WT) and the triple mutant IBR606 (Δ wgcA Δ exoY Δ uxs1‐uxe ) carrying either the control plasmid pJB3Tc19 or pJBpleD*, and (B) Rhizobium etli CFN42 (WT) and the Δ celAB mutant carrying
▲ Effect of other c‐di‐GMP‐regulated EPS on MLG production. Quantification of MLG in (A) Sinorhizobium meliloti 8530 (WT) and the triple mutant IBR606 (Δ wgcA Δ exoY Δ uxs1‐uxe ) carrying either the control plasmid pJB3Tc19 or pJBpleD*, and (B) Rhizobium etli CFN42 (WT) and the Δ celAB mutant carrying

研究结果

其他c-di-GMP调控型EPS并非MLG产量的主要制约因素

在生理c-di-GMP水平下,野生型S. meliloti 8530的MLG产量低于检测限。三重突变体IBR606(ΔwgcA ΔexoY Δuxs1-uxe)的背景中,MLG产量相对于野生型未见显著提升。当引入质粒pJBpleD\(表达组成型活性二鸟苷酸环化酶,提高胞内c-di-GMP水平)后,IBR606的MLG产量显著提升,略高于野生型携带同一质粒的水平,但该差异无统计学意义。这一结果表明,S. meliloti*合成EPS I、EPS II和APS的能力对MLG产量并无重大影响——换言之,竞争性碳流并非限制MLG高效合成的瓶颈。

TolC是MLG生物合成的必需组分

遗传学证据清晰地表明TolC的关键地位:tolC基因的遗传破坏完全消除了MLG合成,而回补该基因则恢复了MLG生产能力。这确立了TolC作为MLG生物合成机器的核心组分,而非辅助因子的地位。研究团队据此提出,TolC与BgsA、BgsB共同构成三组分复合物,协同完成聚合物的合成与/或分泌——TolC作为外膜蛋白,很可能充当了聚合物穿越外膜的通道。

共过表达策略实现8倍产量提升

tolCbgsBApleD\**共过表达,相较于不含tolC*的对照质粒,MLG产量实现了8倍的提升。在生物反应器条件下,该工程菌株的MLG产量达到约10 g/L。这一数据充分证明了TolC在MLG高效合成中的限速作用——缺乏该外膜蛋白时,即便上游合成通路被充分激活,产量仍受严重制约。

TolC is required for MLG production. (A) Plasmid structure of pJBpleD*9091 and its derivative pJBpleD*9091C overexpressing tolC , constructed in this work. (B) Quantification of MLG production in S. meliloti 2011 and their tolC mutant derivative. MLG levels were measured in the wild‐type strains and
▲ TolC is required for MLG production. (A) Plasmid structure of pJBpleD*9091 and its derivative pJBpleD*9091C overexpressing tolC , constructed in this work. (B) Quantification of MLG production in S. meliloti 2011 and their tolC mutant derivative. MLG levels were measured in the wild‐type strains and

模块化设计实现异源宿主中的从头合成

该遗传模块的另一个突出优势在于其可移植性。将tolC-bgsBA-pleD\**模块导入原本不产MLG的根瘤菌宿主——日本中生根瘤菌(M. japonicum),成功实现了MLG的从头合成(de novo production)。这一结果表明,该模块并非仅适用于天然产MLG的S. meliloti,而是可以作为一套功能完整的“合成盒”在不同细菌底盘间转移。原文摘要未提供M. japonicum*异源表达的具体产量数值。

TolC 过表达提高苜蓿中华根瘤菌中 MLG 产量。(A)在含有 pJB3Tc19、pJBpleD*9091 或
▲ TolC 过表达提高苜蓿中华根瘤菌中 MLG 产量。(A)在含有 pJB3Tc19、pJBpleD*9091 或

讨论与展望

TolC在MLG生物合成中的必需性,为理解细菌多糖分泌机制提供了新的视角。在革兰氏阴性菌中,TolC家族蛋白通常作为RND型外排泵的外膜通道组分,参与多种底物(包括药物、毒素和蛋白质)的跨膜转运。该研究发现TolC直接参与一种结构性多糖的合成与分泌,拓展了人们对TolC功能谱系的认知。三组分复合物模型——BgsA负责糖链延伸、BgsB可能介导内膜转运、TolC充当外膜通道——勾勒出一条跨越周质的聚合物分泌路径。

从应用角度审视,8倍产量提升与10 g/L的生物反应器产量,使MLG的工业化生产迈出了实质性一步。模块在不同根瘤菌宿主间的成功移植,更意味着合成生物学“即插即用”的理念在多糖生产领域得到了又一次验证。未来若能将这一模块引入生长更快速、遗传操作更成熟的工业生产菌株(如大肠杆菌),并配合发酵工艺优化,MLG的规模化应用前景值得期待。当然,TolC与BgsA/BgsB之间的具体分子互作模式、三组分复合物的组装动力学等问题,仍有待结构生物学和生化实验的进一步阐明。

参考来源

Ruiz-Sáez L, Pacheco PJ, Peinado J, Lloret J, Muñoz S. TolC Is Required for a Mixed-Linkage β-Glucan (MLG) Biosynthesis: Engineering Bacteria for MLG Overproduction. Microb Biotechnol. PMID: 42552791.

PMID: 42552791

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