克隆菌落PCR假阳性模板

来源:克隆菌落PCR假阳性模板(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space

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菌落PCR条带亮得晃眼,一测序却是空载——这种假阳性,谁做克隆没踩过几回?挑菌、裂解、加样,看着都顺手,可条带就是会骗人。它骗你的方式还很多:卫星菌落、模板带太多、引物乱配对、质粒气溶胶飘进管子里。别急着怀疑连接效率。这篇按“低级错误→流程分模块→进阶疑难”的顺序,把克隆菌落PCR假阳性的常见来源和验证动作一次拆完。每步都给判断标准和具体参数,你照着做就能排。

第一步:快速排查低级错误

教程配图2:克隆菌落PCR假阳性模板 排查流程示意
▲ 教程配图2:克隆菌落PCR假阳性模板 排查流程示意
教程配图3:克隆菌落PCR假阳性模板 排查流程示意
▲ 教程配图3:克隆菌落PCR假阳性模板 排查流程示意

1. 挑菌挑太大,把培养基和甘油全带进PCR管。 牙签轻触菌落表面,挑直径0.5-1 mm的单菌落,在管壁蹭两下即可;别插进琼脂里,别蘸到甘油管。

2. 菌落没裂解就直接当模板。 10 μL无菌水或10 mM NaOH悬菌,95°C 10分钟,取1-2 μL上清进25 μL体系;整块菌落扔进去会抑制Taq。

3. 引物用了载体通用引物,空载也扩增。 一条载体引物加一条插入片段内部引物,空载就扩不出条带;或者两条

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