来源:CRISPR文库筛选脱靶扩增子测序(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space
文库筛完,命中一大片。你想回头确认几个候选位点的脱靶情况,扩增子测序跑完一看——阴性对照里也冒出5%的编辑率,某几个位点的数值比GUIDE-seq高出三四倍。是引物设计背锅,还是PCR条件太松?这篇教程按操作流程走一遍:从gDNA用量、引物特异性、两轮PCR循环数,到index hopping和数据分析阈值。每一步都给参数和验证动作,照着做,大概率能定位到那根坏掉的链条。
第一步:快速排查低级错误


新手翻车,八成问题出在这四件事上。别急着