细胞培养基支原体污染快检

来源:细胞培养基支原体污染快检(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space

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细胞养得好好的,快检却给你一记闷棍?qPCR阴性、培养法阳性,或者NTC先起峰。别急。支原体快检的坑,八成藏在取样、对照和判读里。这篇按“先查低级错、再按流程拆、最后啃疑难”走,覆盖qPCR、LAMP和培养法。每步给判断、验证和解决动作。你照着做,能把假阴性、假阳性和弱阳性分开。

第一步:快速排查低级错误

  • 取样直接吸到底部细胞?轻晃T25瓶,取1 mL上清,300×g离心5分钟,别刮细胞沉淀。
  • NTC忘了加,或者水和模板共用枪头?每板上机前先加NTC,水与模板分两区加,换枪头。
  • qPCR mix反复冻融超过5次?分装成20 μL/管,-20°C避光存,用一管拿一管。
  • 阳性对照和待检样本同区开盖?阳性对照最后加,开盖前离心10秒,超净台紫外30分钟。
教程配图2:细胞培养基支原体污染快检 排查流程示意
▲ 教程配图2:细胞培养基支原体污染快检 排查流程示意

第二步:分维度系统排查

1. 取样与前处理:同一瓶细胞Ct忽高忽低。

现象:今天Ct 34,明天Ct 38,复孔差2个循环以上。原理:支原体在培养上清和细胞表面分布不匀,取到细胞沉淀会带入DNA和抑制物。解决:轻晃T25瓶,取1 mL上清;300×g离心5分钟去细胞,取上清100 μL;12000×g离心10分钟浓缩,弃900 μL,留100 μL,95°C热裂解10分钟。验证:同瓶取3个点复测,Ct差小于1.5;内参Ct大于30就稀释5倍再上机。

2. 核酸提取与抑制物:曲线被压扁。

现象:样本管扩增曲线低平,内参Ct比NTC推迟2-3个循环。原理:培养基酚红、血清蛋白、细胞DNA会抑制Taq酶。解决:柱纯化按说明书做,最后洗脱30 μL;直接裂解法加BSA至0.1 mg/mL;血红素高时稀释10倍。验证:加10³ copies/μL外源对照,回收率应大于70%。回收率低,别硬判阴性。

3. qPCR体系与程序:阳性对照起峰晚、熔解曲线双峰。

现象:阳性对照Ct从28掉到33,熔解曲线出现双峰。原理:引物二聚体、Mg²⁺偏低、退火温度不匹配。解决:20 μL体系用10 μL 2×mix、0.4 μL 10 μM F/R、2 μL模板、7.2 μL水;程序95°C

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