蛋白纯化盐析与发酵污染排查及细胞培养支原体检测

来源:蛋白纯化电导升高盐析、发酵pH骤降污染排查、细胞培养黑点颗粒支原体、核酸电泳条带弱上样量、质谱峰面积低进样针堵、克隆转化子少感受态效率、蛋白表达量低宿主菌株、发酵菌体自溶发酵时长(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space

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诱导完跑SDS-PAGE,目标条带浅得像没长出来,或者全堆在沉淀里——这大概是蛋白表达最常踩的坑。别急着怀疑自己手气差,大概率是某个环节的参数没对。这篇把从菌株选择、载体序列到诱导温度、培养基的整条链路拆开,7步排查路径,每一步都给你判断依据、解决动作和验证方法。照着做,绝大多数“表达量低”能定位到具体原因。

第一步:快速排查低级错误

1. 抗生素加错了或者忘了加。氨苄青霉素用100 μg/mL,卡那霉素50 μg/mL,氨苄平板最好现配现用,超过一周效价掉得厉害。解决:从甘油管重新划板,挑单克隆过夜。

2. 诱导时菌太稀或太浓。OD600不到0.4就加IPTG,菌还没长起来;超过1.0再加,代谢已经往次级产物走了。解决:OD600到0.6-0.8再加诱导剂。

3. IPTG浓度和诱导时间不对。常用0.1-1 mM,37°C诱导3-4小时或16°C过夜。有人直接上1 mM还只诱导1小时,条带当然弱。解决:先试0.5 mM IPTG、37°C 4小时。

4. 菌株标签贴错了。DH5α是克隆菌,没有T7 RNA聚合酶,用它表达pET系列质粒基本白搭。解决:表达用BL21(DE3),从甘油管重新划线确认。

教程配图2:蛋白纯化电导升高盐析、发酵pH骤降污染排查、细胞培养黑点颗粒支原体、核酸电泳条带 排查流程示意
▲ 教程配图2:蛋白纯化电导升高盐析、发酵pH骤降污染排查、细胞培养黑点颗粒支原体、核酸电泳条带 排查流程示意

第二步:分维度系统排查

按实验流程走,从序列到培养,每个模块给判断和动作。

1. 载体序列与密码子

现象:小试诱导后SDS-PAGE目标位置几乎没条带,Western也弱。

原理:大肠杆菌里AGG/AGA等稀有密码子多了,翻译会卡住;mRNA 5'端二级结构太强,核糖体结合

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