蛋白电泳条带拖尾胶浓度梯度

来源:蛋白电泳条带拖尾胶浓度梯度(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space

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跑SDS-PAGE最烦看到条带往下拖、边缘翘、整孔糊成一片。拖尾不一定是样品坏了。胶浓度梯度、灌胶混匀、盐浓度、电压发热都能背锅。下面按制胶到电泳的顺序,给你判断动作和常用参数,把“拖尾”定位到具体一步。

第一步:快速排查低级错误

1. 胶没混匀就灌。现象:整板条带斜拖或局部模糊。解决:加APS/TEMED后轻柔颠倒5-8次,别起泡,立即灌。

2. APS/TEMED失活。现象:30-60分钟不凝,或胶软塌塌。解决:10% APS现配,10 mL胶加100 µL APS、5-10 µL TEMED,室温聚合45-60分钟。

3. 样品盐太高或上样量太大。现象:整孔下拖,边缘发亮。解决:5× loading稀释,盐尽量低于50 mM,每孔上10-30 µg,总蛋白别超40 µg。

4. 拔梳子太早或孔没冲净。现象:孔底碎胶,条带歪斜。解决:聚合后再等20分钟,拔梳子后用注射器冲孔2-3次。

教程配图2:蛋白电泳条带拖尾胶浓度梯度 排查流程示意
▲ 教程配图2:蛋白电泳条带拖尾胶浓度梯度 排查流程示意

第二步:分维度系统排查

A. 样品制备

1. 还原不彻底、蛋白聚集。现象:高分子量条带拖尾,泳道顶部有团块。原理:二硫键没断,SDS结合不均。解决:5× loading含100 mM DTT或5% β-ME,95°C 5-10分钟;难溶蛋白可37°C 30分钟,或加8 M尿素、1% SDS后再煮沸。上样前12000 g离心5分钟取上清。验证:同一样品跑非还原胶对比,拖尾减轻说明还原到位。

2. 盐、脂、核酸污染。现象:所有条带下拖,染料前沿歪。原理:盐改变电导,核酸黏度大。解决:样品盐低于50 mM;核酸用benzonase 25°C处理10分钟或短时超声;脂质用1% SDS加95°C 5分钟。验证:稀释5倍上样,拖尾变轻就是污染。

B. 制胶与胶浓度梯度

3. 分离胶浓度不匹配。现象:目标条带拖尾,胶底部挤成窄带。原理:孔径和蛋白分子量不匹配,小蛋白在低浓度胶里扩散。解决:10-40 kDa用15%或4-20%梯度胶;40-100 kDa用10-12%;大于100 kDa用6-8%。验证:同一品

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