血浆游离DNA得率低采血管选择

来源:血浆游离DNA得率低采血管选择(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space

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抽完血,提cfDNA,Qubit读数0.2 ng/µL甚至无值?别急着怪试剂盒。血浆游离DNA得率低,常常在采血管和采血后那几小时就埋雷了。本文按采血管选择、采血顺序、混匀、运输、离心、血浆分装、提取来排查,给你能直接照做的参数和验证动作。覆盖EDTA、Streck BCT、枸橼酸、肝素等常见管,也讲溶血、白细胞裂解和基因组DNA污染怎么区分。

第一步:快速排查低级错误

  • 用错采血管:做cfDNA却拿普通促凝管或血清管。血清管凝血时白细胞裂解,gDNA飙升,cfDNA被稀释。解决:换K2 EDTA管或专用cfDNA保存管,如Streck BCT。
  • 采血量不足:10 mL管只抽3 mL,抗凝剂比例失衡,血浆量少还容易凝。解决:真空管抽至刻度线,至少8-10 mL。
  • 采血后没混匀:EDTA管抽完直立不动,管壁抗凝剂没溶开。解决:采血后立即轻柔颠倒8-10次,别剧烈振荡。
  • 室温放太久:EDTA管室温搁4小时以上才离心。解决:2小时内离心;要运输过夜,直接上Streck BCT。
教程配图2:血浆游离DNA得率低采血管选择 排查流程示意
▲ 教程配图2:血浆游离DNA得率低采血管选择 排查流程示意

第二步:分维度系统排查

1. 采血管类型与保存能力

现象:EDTA管得率从1 ng/µL掉到0.1 ng/µL,Bioanalyzer出现>1 kb gDNA峰。原理:EDTA只抗凝,不抑制白细胞凋亡。室温>4 h,白细胞裂解释放gDNA,提取柱饱和,短片段cfDNA回收下降。解决:若2 h内离心,K2 EDTA管够用;若需运输或过夜,换Streck cfDNA BCT,室温15-25°C保存,别冷冻。验证:同一人抽两管,一管EDTA立即离心,一管BCT室温放72 h再离心。Qubit HS测浓度,Bioanalyzer看170 bp cfDNA峰和>1 kb gDNA峰。BCT管gDNA峰低于5%,说明管选对了。

2. 采血顺序与抗凝剂比例

现象:血浆发红,或有纤维蛋白丝,提取后A260/280<1.6。原理:EDTA不足,钙离子残留,凝血级联启动;溶血释放血红素抑制PCR。解决:多管采血顺序用血培养→凝血→血清→肝素→EDTA→cfDNA专用管。EDTA管抽满至10 mL,抗凝剂终浓度约1.5-2 mg/mL。验证:离心后看血浆颜色,淡黄透明合格;红色则溶血,弃用。

3. 混匀与运输

现象:管底有胶冻状凝块,血浆得量少。原理:没混匀,抗凝剂局部浓度高,血液局部凝集。解决:采血后立即颠倒8-10次,5秒内完成;运输用15-25°C,别放冰袋,别剧烈摇晃。BCT管可室温放3天;EDTA管必须2 h内到实验室。

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