核酸自动化提取磁珠残留抑制

来源:核酸自动化提取磁珠残留抑制(DNA Lab Space 实验教程)| 编译:DNA Lab Space

📎 相关工具:参考文献格式化

提取仪跑完,上清看着清亮,qPCR却整体晚3-5个Ct,复孔之间还跳。换试剂盒、换引物,问题照旧。别急着怪酶。八成是磁珠或洗液残留跟着核酸进了扩增体系。磁珠本身吸附Taq聚合酶,乙醇和胍盐直接压住反应。这篇按流程拆开讲,从裂解结合、磁分离、洗涤、干燥到洗脱和下游加样,一步一个动作。照着做,能定位到具体是哪一步漏了。

第一步:先排除4个低级错误

教程配图2:核酸自动化提取磁珠残留抑制 排查流程示意
▲ 教程配图2:核酸自动化提取磁珠残留抑制 排查流程示意
教程配图3:核酸自动化提取磁珠残留抑制 排查流程示意
▲ 教程配图3:核酸自动化提取磁珠残留抑制 排查流程示意

1. 磁吸时间不够就吸上清。 仪器默认30 s,很多板子根本吸不干净。改到2-3 min,或把程序里磁吸延时拉到180 s。

2. 洗涤后没干燥直接洗脱。 70%乙醇残留5 µL就能让Ct晚2个循环。干燥步骤给65°C 5 min,别省。

3. 磁珠悬液没混匀就分装。 磁珠沉降快,30 s就分层。用前涡旋30 s,或仪器振荡2000 rpm 2 min。

4. **洗脱体积低于50 µL

延伸阅读:更多代谢通路设计、多基因组装等合成生物学工具,可访问 DNA Lab Space

📎 相关文章

MALDI质谱峰抑制基质结晶优化 09-12 生物传感器响应漂移参比电极维护 09-12 蛋白冻干塌陷赋形剂配比优化 09-12 毛细管电泳峰形异常缓冲液老化 09-12